Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTF1Q16619 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTF1Q16619 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTF1Q16619 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTF1Q16619 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTF1Q16619 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTF1Q16619 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTF1Q16619 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTF1Q16619 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTF1Q16619 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTF1Q16619 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTF1Q16619 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTF1Q16619 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTF1Q16619 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTF1Q16619 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTF1Q16619 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTF1Q16619 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTF1Q16619 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTF1Q16619 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTF1Q16619 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTF1Q16619 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTF1Q16619 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTF1Q16619 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTF1Q16619 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTF1Q16619 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTF1Q16619 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTF1Q16619 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTF1Q16619 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTF1Q16619 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTF1Q16619 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTF1Q16619 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTF1Q16619 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTF1Q16619 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTF1Q16619 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTF1Q16619 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTF1Q16619 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTF1Q16619 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTF1Q16619 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTF1Q16619 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTF1Q16619 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTF1Q16619 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTF1Q16619 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTF1Q16619 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTF1Q16619 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTF1Q16619 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTF1Q16619 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTF1Q16619 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTF1Q16619 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTF1Q16619 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTF1Q16619 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTF1Q16619 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTF1Q16619 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTF1Q16619 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTF1Q16619 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTF1Q16619 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTF1Q16619 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTF1Q16619 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTF1Q16619 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTF1Q16619 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTF1Q16619 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTF1Q16619 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTF1Q16619 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTF1Q16619 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTF1Q16619 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTF1Q16619 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTF1Q16619 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTF1Q16619 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTF1Q16619 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTF1Q16619 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTF1Q16619 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTF1Q16619 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTF1Q16619 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTF1Q16619 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTF1Q16619 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTF1Q16619 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTF1Q16619 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTF1Q16619 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTF1Q16619 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTF1Q16619 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
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