Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 LSC2YGR244C 1284 nt11.59□□□□□ -0.55
SSF2Q12153 YGR259CYGR259C 441 nt11.59□□□□□ -0.55
SSF2Q12153 POM34YLR018C 900 nt11.59□□□□□ -0.55
SSF2Q12153 YMR244WYMR244W 1068 nt11.58□□□□□ -0.56
SSF2Q12153 BOR1YNL275W 1731 nt11.57□□□□□ -0.56
SSF2Q12153 ARP6YLR085C 1317 nt11.57□□□□□ -0.56
SSF2Q12153 RPL4BYDR012W 1089 nt11.56□□□□□ -0.56
SSF2Q12153 YML089CYML089C 369 nt11.56□□□□□ -0.56
SSF2Q12153 RPL4AYBR031W 1089 nt11.56□□□□□ -0.56
SSF2Q12153 CLB6YGR109C 1143 nt11.55□□□□□ -0.56
SSF2Q12153 ATG15YCR068W 1563 nt11.54□□□□□ -0.56
SSF2Q12153 PEX2YJL210W 816 nt11.54□□□□□ -0.56
SSF2Q12153 BMT6YLR063W 1098 nt11.54□□□□□ -0.56
SSF2Q12153 PLB1YMR008C 1995 nt11.51□□□□□ -0.57
SSF2Q12153 DPS1YLL018C 1674 nt11.5□□□□□ -0.57
SSF2Q12153 UTH1YKR042W 1098 nt11.5□□□□□ -0.57
SSF2Q12153 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.5□□□□□ -0.57
SSF2Q12153 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.5□□□□□ -0.57
SSF2Q12153 HIP1YGR191W 1812 nt11.49□□□□□ -0.57
SSF2Q12153 GAP1YKR039W 1809 nt11.49□□□□□ -0.57
SSF2Q12153 RPS14BYJL191W 417 nt11.48□□□□□ -0.57
SSF2Q12153 SDH5YOL071W 489 nt11.45□□□□□ -0.58
SSF2Q12153 NRT1YOR071C 1797 nt11.45□□□□□ -0.58
SSF2Q12153 TIF6YPR016C 738 nt11.44□□□□□ -0.58
SSF2Q12153 MET28YIR017C 564 nt11.42□□□□□ -0.58
SSF2Q12153 RBG2YGR173W 1107 nt11.39□□□□□ -0.59
SSF2Q12153 YLR111WYLR111W 333 nt11.39□□□□□ -0.59
SSF2Q12153 AAC1YMR056C 930 nt11.38□□□□□ -0.59
SSF2Q12153 YMR226CYMR226C 804 nt11.38□□□□□ -0.59
SSF2Q12153 IRC24YIR036C 792 nt11.37□□□□□ -0.59
SSF2Q12153 TSC10YBR265W 963 nt11.36□□□□□ -0.59
SSF2Q12153 UTR1YJR049C 1593 nt11.35□□□□□ -0.59
SSF2Q12153 FIT3YOR383C 615 nt11.31□□□□□ -0.6
SSF2Q12153 YGR012WYGR012W 1182 nt11.3□□□□□ -0.6
SSF2Q12153 DIF1YLR437C 402 nt11.3□□□□□ -0.6
SSF2Q12153 RAD23YEL037C 1197 nt11.29□□□□□ -0.6
SSF2Q12153 SAM35YHR083W 990 nt11.28□□□□□ -0.6
SSF2Q12153 PRM5YIL117C 957 nt11.27□□□□□ -0.61
SSF2Q12153 SNF1YDR477W 1902 nt11.27□□□□□ -0.61
SSF2Q12153 YAR028WYAR028W 705 nt11.26□□□□□ -0.61
SSF2Q12153 YLR279WYLR279W 390 nt11.24□□□□□ -0.61
SSF2Q12153 AKR2YOR034C 2250 nt11.2□□□□□ -0.62
SSF2Q12153 ALP1YNL270C 1722 nt11.19□□□□□ -0.62
SSF2Q12153 MSB4YOL112W 1479 nt11.19□□□□□ -0.62
SSF2Q12153 ZTA1YBR046C 1005 nt11.18□□□□□ -0.62
SSF2Q12153 MTG2YHR168W 1557 nt11.17□□□□□ -0.62
SSF2Q12153 RIB3YDR487C 627 nt11.16□□□□□ -0.62
SSF2Q12153 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.15□□□□□ -0.62
SSF2Q12153 ALD4YOR374W 1560 nt11.15□□□□□ -0.62
SSF2Q12153 CAB5YDR196C 726 nt11.14□□□□□ -0.63
SSF2Q12153 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.14□□□□□ -0.63
SSF2Q12153 BIO5YNR056C 1686 nt11.12□□□□□ -0.63
SSF2Q12153 SED1YDR077W 1017 nt11.11□□□□□ -0.63
SSF2Q12153 ALG12YNR030W 1656 nt11.11□□□□□ -0.63
SSF2Q12153 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.09□□□□□ -0.63
SSF2Q12153 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.09□□□□□ -0.63
SSF2Q12153 HIF1YLL022C 1158 nt11.09□□□□□ -0.63
SSF2Q12153 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.09□□□□□ -0.63
SSF2Q12153 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.09□□□□□ -0.63
SSF2Q12153 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.09□□□□□ -0.63
SSF2Q12153 LIP1YMR298W 453 nt11.07□□□□□ -0.64
SSF2Q12153 SAM1YLR180W 1149 nt11.06□□□□□ -0.64
SSF2Q12153 HXT1YHR094C 1713 nt11.05□□□□□ -0.64
SSF2Q12153 DBP1YPL119C 1854 nt11.02□□□□□ -0.64
SSF2Q12153 GND1YHR183W 1470 nt11□□□□□ -0.65
SSF2Q12153 LOT5YKL183W 921 nt10.99□□□□□ -0.65
SSF2Q12153 YBL086CYBL086C 1401 nt10.97□□□□□ -0.65
SSF2Q12153 FCY21YER060W 1587 nt10.95□□□□□ -0.66
SSF2Q12153 SMM1YNR015W 1155 nt10.95□□□□□ -0.66
SSF2Q12153 YPL251WYPL251W 303 nt10.95□□□□□ -0.66
SSF2Q12153 SSN3YPL042C 1668 nt10.95□□□□□ -0.66
SSF2Q12153 TOA2YKL058W 369 nt10.94□□□□□ -0.66
SSF2Q12153 BRR1YPR057W 1026 nt10.94□□□□□ -0.66
SSF2Q12153 UGA4YDL210W 1716 nt10.94□□□□□ -0.66
SSF2Q12153 YPI1YFR003C 468 nt10.93□□□□□ -0.66
SSF2Q12153 BSP1YPR171W 1731 nt10.92□□□□□ -0.66
SSF2Q12153 APT2YDR441C 546 nt10.91□□□□□ -0.66
SSF2Q12153 MEP3YPR138C 1470 nt10.91□□□□□ -0.66
SSF2Q12153 LEU9YOR108W 1815 nt10.9□□□□□ -0.66
SSF2Q12153 SHY1YGR112W 1170 nt10.89□□□□□ -0.67
SSF2Q12153 YMR103CYMR103C 363 nt10.89□□□□□ -0.67
SSF2Q12153 PRY1YJL079C 900 nt10.87□□□□□ -0.67
SSF2Q12153 ZRT3YKL175W 1512 nt10.87□□□□□ -0.67
SSF2Q12153 UME6YDR207C 2511 nt10.86□□□□□ -0.67
SSF2Q12153 ADH1YOL086C 1047 nt10.86□□□□□ -0.67
SSF2Q12153 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.86□□□□□ -0.67
SSF2Q12153 NAR1YNL240C 1476 nt10.86□□□□□ -0.67
SSF2Q12153 PBP1YGR178C 2169 nt10.85□□□□□ -0.67
SSF2Q12153 GND2YGR256W 1479 nt10.85□□□□□ -0.67
SSF2Q12153 YJL195CYJL195C 702 nt10.83□□□□□ -0.68
SSF2Q12153 CYT2YKL087C 675 nt10.83□□□□□ -0.68
SSF2Q12153 YNR029CYNR029C 1290 nt10.83□□□□□ -0.68
SSF2Q12153 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.82□□□□□ -0.68
SSF2Q12153 UFO1YML088W 2007 nt10.79□□□□□ -0.68
SSF2Q12153 RIB2YOL066C 1776 nt10.78□□□□□ -0.68
SSF2Q12153 SAM2YDR502C 1155 nt10.78□□□□□ -0.68
SSF2Q12153 VRG4YGL225W 1014 nt10.78□□□□□ -0.68
SSF2Q12153 FUN14YAL008W 597 nt10.78□□□□□ -0.68
SSF2Q12153 URA6YKL024C 615 nt10.78□□□□□ -0.68
SSF2Q12153 Q0010Q0010 387 nt10.78□□□□□ -0.68
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