Protein–RNA interactions for Protein: Q12049

THP3, Protein THP3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP3Q12049 TPO4YOR273C 1980 nt9.19□□□□□ -0.94
THP3Q12049 YCR102CYCR102C 1107 nt9.18□□□□□ -0.94
THP3Q12049 NBP35YGL091C 987 nt9.18□□□□□ -0.94
THP3Q12049 YNL115CYNL115C 1935 nt9.18□□□□□ -0.94
THP3Q12049 ZRT3YKL175W 1512 nt9.17□□□□□ -0.94
THP3Q12049 UTR1YJR049C 1593 nt9.12□□□□□ -0.95
THP3Q12049 YFL066CYFL066C 1179 nt9.11□□□□□ -0.95
THP3Q12049 PEX25YPL112C 1185 nt9.11□□□□□ -0.95
THP3Q12049 YJL067WYJL067W 351 nt9.1□□□□□ -0.95
THP3Q12049 UGA4YDL210W 1716 nt9.1□□□□□ -0.95
THP3Q12049 ACO2YJL200C 2370 nt9.06□□□□□ -0.96
THP3Q12049 ILV3YJR016C 1758 nt9.06□□□□□ -0.96
THP3Q12049 VPS75YNL246W 795 nt9.05□□□□□ -0.96
THP3Q12049 SHH4YLR164W 507 nt9.01□□□□□ -0.97
THP3Q12049 TIR3YIL011W 810 nt9□□□□□ -0.97
THP3Q12049 YNL024CYNL024C 741 nt9□□□□□ -0.97
THP3Q12049 GAP1YKR039W 1809 nt9□□□□□ -0.97
THP3Q12049 URA8YJR103W 1737 nt9□□□□□ -0.97
THP3Q12049 SAM35YHR083W 990 nt8.99□□□□□ -0.97
THP3Q12049 YOR325WYOR325W 474 nt8.99□□□□□ -0.97
THP3Q12049 ESBP6YNL125C 2022 nt8.98□□□□□ -0.97
THP3Q12049 PRO1YDR300C 1287 nt8.98□□□□□ -0.97
THP3Q12049 PAU7YAR020C 168 nt8.98□□□□□ -0.97
THP3Q12049 LSC2YGR244C 1284 nt8.97□□□□□ -0.97
THP3Q12049 YMR209CYMR209C 1374 nt8.97□□□□□ -0.97
THP3Q12049 DBP1YPL119C 1854 nt8.95□□□□□ -0.98
THP3Q12049 UGP1YKL035W 1500 nt8.95□□□□□ -0.98
THP3Q12049 GTB1YDR221W 2109 nt8.94□□□□□ -0.98
THP3Q12049 YDR094WYDR094W 336 nt8.93□□□□□ -0.98
THP3Q12049 YFR018CYFR018C 1092 nt8.93□□□□□ -0.98
THP3Q12049 HIS2YFR025C 1008 nt8.93□□□□□ -0.98
THP3Q12049 PRE6YOL038W 765 nt8.93□□□□□ -0.98
THP3Q12049 COQ8YGL119W 1506 nt8.93□□□□□ -0.98
THP3Q12049 ILV2YMR108W 2064 nt8.92□□□□□ -0.98
THP3Q12049 POM34YLR018C 900 nt8.92□□□□□ -0.98
THP3Q12049 ATG15YCR068W 1563 nt8.91□□□□□ -0.98
THP3Q12049 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.91□□□□□ -0.98
THP3Q12049 YDR010CYDR010C 333 nt8.89□□□□□ -0.99
THP3Q12049 SHY1YGR112W 1170 nt8.89□□□□□ -0.99
THP3Q12049 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.89□□□□□ -0.99
THP3Q12049 SHB17YKR043C 816 nt8.88□□□□□ -0.99
THP3Q12049 OPI10YOL032W 741 nt8.88□□□□□ -0.99
THP3Q12049 ARO8YGL202W 1503 nt8.88□□□□□ -0.99
THP3Q12049 HXT1YHR094C 1713 nt8.88□□□□□ -0.99
THP3Q12049 SFA1YDL168W 1161 nt8.87□□□□□ -0.99
THP3Q12049 UBX6YJL048C 1191 nt8.87□□□□□ -0.99
THP3Q12049 TOM6YOR045W 186 nt8.87□□□□□ -0.99
THP3Q12049 RFC1YOR217W 2586 nt8.87□□□□□ -0.99
THP3Q12049 YHL008CYHL008C 1884 nt8.85□□□□□ -0.99
THP3Q12049 YML089CYML089C 369 nt8.84□□□□□ -0.99
THP3Q12049 SGA1YIL099W 1650 nt8.83□□□□□ -1
THP3Q12049 DIF1YLR437C 402 nt8.82□□□□□ -1
THP3Q12049 ZAP1YJL056C 2643 nt8.82□□□□□ -1
THP3Q12049 CCT2YIL142W 1584 nt8.81□□□□□ -1
THP3Q12049 KES1YPL145C 1305 nt8.8□□□□□ -1
THP3Q12049 DTR1YBR180W 1719 nt8.8□□□□□ -1
THP3Q12049 PEX2YJL210W 816 nt8.79□□□□□ -1
THP3Q12049 LSB6YJL100W 1824 nt8.79□□□□□ -1
THP3Q12049 PHO89YBR296C 1725 nt8.79□□□□□ -1
THP3Q12049 RET2YFR051C 1641 nt8.79□□□□□ -1
THP3Q12049 RRT5YFR032C 870 nt8.78□□□□□ -1
THP3Q12049 MIR1YJR077C 936 nt8.78□□□□□ -1
THP3Q12049 PSD1YNL169C 1503 nt8.78□□□□□ -1
THP3Q12049 URA6YKL024C 615 nt8.77□□□□□ -1.01
THP3Q12049 THI72YOR192C 1800 nt8.77□□□□□ -1.01
THP3Q12049 UBA4YHR111W 1323 nt8.77□□□□□ -1.01
THP3Q12049 YBL086CYBL086C 1401 nt8.76□□□□□ -1.01
THP3Q12049 MRP20YDR405W 792 nt8.75□□□□□ -1.01
THP3Q12049 RSC8YFR037C 1674 nt8.75□□□□□ -1.01
THP3Q12049 CWC15YDR163W 528 nt8.74□□□□□ -1.01
THP3Q12049 TIF6YPR016C 738 nt8.74□□□□□ -1.01
THP3Q12049 GAL2YLR081W 1725 nt8.74□□□□□ -1.01
THP3Q12049 BET2YPR176C 978 nt8.73□□□□□ -1.01
THP3Q12049 UFO1YML088W 2007 nt8.73□□□□□ -1.01
THP3Q12049 DMA2YNL116W 1569 nt8.73□□□□□ -1.01
THP3Q12049 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.72□□□□□ -1.01
THP3Q12049 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.72□□□□□ -1.01
THP3Q12049 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.72□□□□□ -1.01
THP3Q12049 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.72□□□□□ -1.01
THP3Q12049 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.72□□□□□ -1.01
THP3Q12049 TOK1YJL093C 2076 nt8.71□□□□□ -1.01
THP3Q12049 YSR3YKR053C 1215 nt8.71□□□□□ -1.02
THP3Q12049 COQ2YNR041C 1119 nt8.71□□□□□ -1.02
THP3Q12049 LIP1YMR298W 453 nt8.7□□□□□ -1.02
THP3Q12049 CYT1YOR065W 930 nt8.7□□□□□ -1.02
THP3Q12049 HIP1YGR191W 1812 nt8.7□□□□□ -1.02
THP3Q12049 THI74YDR438W 1113 nt8.69□□□□□ -1.02
THP3Q12049 PAU16YKL224C 372 nt8.69□□□□□ -1.02
THP3Q12049 YAR028WYAR028W 705 nt8.69□□□□□ -1.02
THP3Q12049 YHR218WYHR218W 1812 nt8.67□□□□□ -1.02
THP3Q12049 FRE6YLL051C 2139 nt8.67□□□□□ -1.02
THP3Q12049 LEU9YOR108W 1815 nt8.66□□□□□ -1.02
THP3Q12049 SED1YDR077W 1017 nt8.66□□□□□ -1.02
THP3Q12049 MET28YIR017C 564 nt8.66□□□□□ -1.02
THP3Q12049 BSP1YPR171W 1731 nt8.66□□□□□ -1.02
THP3Q12049 ACH1YBL015W 1581 nt8.65□□□□□ -1.02
THP3Q12049 XYL2YLR070C 1071 nt8.65□□□□□ -1.02
THP3Q12049 ZTA1YBR046C 1005 nt8.65□□□□□ -1.02
THP3Q12049 ODC1YPL134C 933 nt8.64□□□□□ -1.03
THP3Q12049 MTG2YHR168W 1557 nt8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23 ms