Protein–RNA interactions for Protein: Q12046

CWC2, Pre-mRNA-splicing factor CWC2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CWC2Q12046 NAT4YMR069W 858 nt10.81□□□□□ -0.68
CWC2Q12046 MSF1YPR047W 1410 nt10.81□□□□□ -0.68
CWC2Q12046 GAP1YKR039W 1809 nt10.8□□□□□ -0.68
CWC2Q12046 PRM5YIL117C 957 nt10.8□□□□□ -0.68
CWC2Q12046 UTR1YJR049C 1593 nt10.79□□□□□ -0.68
CWC2Q12046 YSR3YKR053C 1215 nt10.79□□□□□ -0.68
CWC2Q12046 TOM6YOR045W 186 nt10.78□□□□□ -0.68
CWC2Q12046 XYL2YLR070C 1071 nt10.75□□□□□ -0.69
CWC2Q12046 COQ2YNR041C 1119 nt10.75□□□□□ -0.69
CWC2Q12046 ATG15YCR068W 1563 nt10.74□□□□□ -0.69
CWC2Q12046 YGL034CYGL034C 366 nt10.72□□□□□ -0.69
CWC2Q12046 PEX2YJL210W 816 nt10.7□□□□□ -0.7
CWC2Q12046 CYT2YKL087C 675 nt10.7□□□□□ -0.7
CWC2Q12046 YML089CYML089C 369 nt10.7□□□□□ -0.7
CWC2Q12046 HIF1YLL022C 1158 nt10.69□□□□□ -0.7
CWC2Q12046 HIP1YGR191W 1812 nt10.68□□□□□ -0.7
CWC2Q12046 TIF6YPR016C 738 nt10.67□□□□□ -0.7
CWC2Q12046 DIF1YLR437C 402 nt10.65□□□□□ -0.7
CWC2Q12046 ALD4YOR374W 1560 nt10.65□□□□□ -0.71
CWC2Q12046 YCR087WYCR087W 516 nt10.64□□□□□ -0.71
CWC2Q12046 MRP20YDR405W 792 nt10.64□□□□□ -0.71
CWC2Q12046 AIM45YPR004C 1035 nt10.62□□□□□ -0.71
CWC2Q12046 YAT1YAR035W 2064 nt10.58□□□□□ -0.72
CWC2Q12046 RBG1YAL036C 1110 nt10.56□□□□□ -0.72
CWC2Q12046 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.54□□□□□ -0.72
CWC2Q12046 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.54□□□□□ -0.72
CWC2Q12046 RPL4BYDR012W 1089 nt10.54□□□□□ -0.72
CWC2Q12046 RPS14BYJL191W 417 nt10.54□□□□□ -0.72
CWC2Q12046 RPL4AYBR031W 1089 nt10.54□□□□□ -0.72
CWC2Q12046 SAM35YHR083W 990 nt10.53□□□□□ -0.72
CWC2Q12046 MET28YIR017C 564 nt10.53□□□□□ -0.72
CWC2Q12046 DBP1YPL119C 1854 nt10.53□□□□□ -0.72
CWC2Q12046 NRT1YOR071C 1797 nt10.52□□□□□ -0.73
CWC2Q12046 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.5□□□□□ -0.73
CWC2Q12046 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.5□□□□□ -0.73
CWC2Q12046 UTH1YKR042W 1098 nt10.5□□□□□ -0.73
CWC2Q12046 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.5□□□□□ -0.73
CWC2Q12046 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.5□□□□□ -0.73
CWC2Q12046 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.5□□□□□ -0.73
CWC2Q12046 MTG2YHR168W 1557 nt10.49□□□□□ -0.73
CWC2Q12046 CLB6YGR109C 1143 nt10.48□□□□□ -0.73
CWC2Q12046 YAR028WYAR028W 705 nt10.48□□□□□ -0.73
CWC2Q12046 ZTA1YBR046C 1005 nt10.48□□□□□ -0.73
CWC2Q12046 NDI1YML120C 1542 nt10.47□□□□□ -0.73
CWC2Q12046 HXT1YHR094C 1713 nt10.44□□□□□ -0.74
CWC2Q12046 YBL086CYBL086C 1401 nt10.42□□□□□ -0.74
CWC2Q12046 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.41□□□□□ -0.74
CWC2Q12046 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.41□□□□□ -0.74
CWC2Q12046 SBA1YKL117W 651 nt10.41□□□□□ -0.74
CWC2Q12046 SED1YDR077W 1017 nt10.4□□□□□ -0.74
CWC2Q12046 AKR2YOR034C 2250 nt10.4□□□□□ -0.75
CWC2Q12046 ZRT3YKL175W 1512 nt10.39□□□□□ -0.75
CWC2Q12046 SHY1YGR112W 1170 nt10.39□□□□□ -0.75
CWC2Q12046 LIP1YMR298W 453 nt10.39□□□□□ -0.75
CWC2Q12046 FIT3YOR383C 615 nt10.38□□□□□ -0.75
CWC2Q12046 RPC82YPR190C 1965 nt10.37□□□□□ -0.75
CWC2Q12046 ALP1YNL270C 1722 nt10.37□□□□□ -0.75
CWC2Q12046 YJL067WYJL067W 351 nt10.36□□□□□ -0.75
CWC2Q12046 YLR279WYLR279W 390 nt10.36□□□□□ -0.75
CWC2Q12046 YPL251WYPL251W 303 nt10.35□□□□□ -0.75
CWC2Q12046 TSC10YBR265W 963 nt10.33□□□□□ -0.76
CWC2Q12046 LEU9YOR108W 1815 nt10.33□□□□□ -0.76
CWC2Q12046 MSB4YOL112W 1479 nt10.32□□□□□ -0.76
CWC2Q12046 UFO1YML088W 2007 nt10.31□□□□□ -0.76
CWC2Q12046 CAB5YDR196C 726 nt10.3□□□□□ -0.76
CWC2Q12046 YGR012WYGR012W 1182 nt10.3□□□□□ -0.76
CWC2Q12046 CMP2YML057W 1815 nt10.29□□□□□ -0.76
CWC2Q12046 SDH5YOL071W 489 nt10.29□□□□□ -0.76
CWC2Q12046 GLR1YPL091W 1452 nt10.29□□□□□ -0.76
CWC2Q12046 INA1YLR413W 2028 nt10.28□□□□□ -0.76
CWC2Q12046 BRR1YPR057W 1026 nt10.28□□□□□ -0.76
CWC2Q12046 SAM1YLR180W 1149 nt10.26□□□□□ -0.77
CWC2Q12046 TOA2YKL058W 369 nt10.25□□□□□ -0.77
CWC2Q12046 UGA4YDL210W 1716 nt10.24□□□□□ -0.77
CWC2Q12046 SPT20YOL148C 1815 nt10.24□□□□□ -0.77
CWC2Q12046 YMR244WYMR244W 1068 nt10.24□□□□□ -0.77
CWC2Q12046 URA6YKL024C 615 nt10.23□□□□□ -0.77
CWC2Q12046 YMR103CYMR103C 363 nt10.23□□□□□ -0.77
CWC2Q12046 GND2YGR256W 1479 nt10.22□□□□□ -0.77
CWC2Q12046 MEP3YPR138C 1470 nt10.2□□□□□ -0.78
CWC2Q12046 RAD23YEL037C 1197 nt10.18□□□□□ -0.78
CWC2Q12046 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.18□□□□□ -0.78
CWC2Q12046 OYE3YPL171C 1203 nt10.18□□□□□ -0.78
CWC2Q12046 HSL7YBR133C 2484 nt10.16□□□□□ -0.78
CWC2Q12046 FCY21YER060W 1587 nt10.16□□□□□ -0.78
CWC2Q12046 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.14□□□□□ -0.79
CWC2Q12046 YLR111WYLR111W 333 nt10.12□□□□□ -0.79
CWC2Q12046 FLR1YBR008C 1647 nt10.11□□□□□ -0.79
CWC2Q12046 RIB3YDR487C 627 nt10.11□□□□□ -0.79
CWC2Q12046 PET8YNL003C 855 nt10.11□□□□□ -0.79
CWC2Q12046 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.11□□□□□ -0.79
CWC2Q12046 YOR325WYOR325W 474 nt10.1□□□□□ -0.79
CWC2Q12046 FMS1YMR020W 1527 nt10.08□□□□□ -0.8
CWC2Q12046 SSN3YPL042C 1668 nt10.08□□□□□ -0.8
CWC2Q12046 ACH1YBL015W 1581 nt10.07□□□□□ -0.8
CWC2Q12046 CWC15YDR163W 528 nt10.07□□□□□ -0.8
CWC2Q12046 SMM1YNR015W 1155 nt10.06□□□□□ -0.8
CWC2Q12046 BNI5YNL166C 1347 nt10.06□□□□□ -0.8
CWC2Q12046 APT2YDR441C 546 nt10.05□□□□□ -0.8
CWC2Q12046 PRY1YJL079C 900 nt10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms