Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 RET2YFR051C 1641 nt9.56□□□□□ -0.88
YHC1Q05900 UBA4YHR111W 1323 nt9.56□□□□□ -0.88
YHC1Q05900 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.55□□□□□ -0.88
YHC1Q05900 HIF1YLL022C 1158 nt9.54□□□□□ -0.88
YHC1Q05900 THI74YDR438W 1113 nt9.53□□□□□ -0.88
YHC1Q05900 ALD4YOR374W 1560 nt9.52□□□□□ -0.89
YHC1Q05900 ATG15YCR068W 1563 nt9.51□□□□□ -0.89
YHC1Q05900 PHO89YBR296C 1725 nt9.51□□□□□ -0.89
YHC1Q05900 YML089CYML089C 369 nt9.5□□□□□ -0.89
YHC1Q05900 TOM6YOR045W 186 nt9.5□□□□□ -0.89
YHC1Q05900 YSR3YKR053C 1215 nt9.46□□□□□ -0.9
YHC1Q05900 YAT1YAR035W 2064 nt9.46□□□□□ -0.9
YHC1Q05900 NAT4YMR069W 858 nt9.45□□□□□ -0.9
YHC1Q05900 MSF1YPR047W 1410 nt9.45□□□□□ -0.9
YHC1Q05900 COQ2YNR041C 1119 nt9.44□□□□□ -0.9
YHC1Q05900 SAM35YHR083W 990 nt9.43□□□□□ -0.9
YHC1Q05900 DIF1YLR437C 402 nt9.43□□□□□ -0.9
YHC1Q05900 PEX2YJL210W 816 nt9.42□□□□□ -0.9
YHC1Q05900 TIF6YPR016C 738 nt9.42□□□□□ -0.9
YHC1Q05900 HIP1YGR191W 1812 nt9.42□□□□□ -0.9
YHC1Q05900 XYL2YLR070C 1071 nt9.4□□□□□ -0.9
YHC1Q05900 YCR087WYCR087W 516 nt9.39□□□□□ -0.91
YHC1Q05900 MRP20YDR405W 792 nt9.37□□□□□ -0.91
YHC1Q05900 YGL034CYGL034C 366 nt9.37□□□□□ -0.91
YHC1Q05900 DBP1YPL119C 1854 nt9.36□□□□□ -0.91
YHC1Q05900 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.35□□□□□ -0.91
YHC1Q05900 AIM45YPR004C 1035 nt9.33□□□□□ -0.92
YHC1Q05900 ZRT3YKL175W 1512 nt9.32□□□□□ -0.92
YHC1Q05900 MET28YIR017C 564 nt9.32□□□□□ -0.92
YHC1Q05900 CMP2YML057W 1815 nt9.31□□□□□ -0.92
YHC1Q05900 RPL4BYDR012W 1089 nt9.3□□□□□ -0.92
YHC1Q05900 YAR028WYAR028W 705 nt9.3□□□□□ -0.92
YHC1Q05900 RPL4AYBR031W 1089 nt9.3□□□□□ -0.92
YHC1Q05900 HXT1YHR094C 1713 nt9.3□□□□□ -0.92
YHC1Q05900 NDI1YML120C 1542 nt9.3□□□□□ -0.92
YHC1Q05900 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.29□□□□□ -0.92
YHC1Q05900 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.29□□□□□ -0.92
YHC1Q05900 UTH1YKR042W 1098 nt9.29□□□□□ -0.92
YHC1Q05900 NRT1YOR071C 1797 nt9.29□□□□□ -0.92
YHC1Q05900 RPC82YPR190C 1965 nt9.28□□□□□ -0.92
YHC1Q05900 MTG2YHR168W 1557 nt9.28□□□□□ -0.92
YHC1Q05900 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.27□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 CLB6YGR109C 1143 nt9.27□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.27□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 RPS14BYJL191W 417 nt9.27□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.27□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.27□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.27□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 INA1YLR413W 2028 nt9.26□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 YBL086CYBL086C 1401 nt9.24□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 SED1YDR077W 1017 nt9.24□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 SHY1YGR112W 1170 nt9.24□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 YJL067WYJL067W 351 nt9.24□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 SPT20YOL148C 1815 nt9.24□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 HSL7YBR133C 2484 nt9.23□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 RBG1YAL036C 1110 nt9.23□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 LIP1YMR298W 453 nt9.23□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 ZTA1YBR046C 1005 nt9.22□□□□□ -0.93
YHC1Q05900 FIT3YOR383C 615 nt9.21□□□□□ -0.94
YHC1Q05900 ALP1YNL270C 1722 nt9.2□□□□□ -0.94
YHC1Q05900 AKR2YOR034C 2250 nt9.2□□□□□ -0.94
YHC1Q05900 LEU9YOR108W 1815 nt9.17□□□□□ -0.94
YHC1Q05900 YPL251WYPL251W 303 nt9.15□□□□□ -0.94
YHC1Q05900 UFO1YML088W 2007 nt9.15□□□□□ -0.94
YHC1Q05900 URA6YKL024C 615 nt9.13□□□□□ -0.95
YHC1Q05900 SBA1YKL117W 651 nt9.12□□□□□ -0.95
YHC1Q05900 SAM1YLR180W 1149 nt9.12□□□□□ -0.95
YHC1Q05900 BRR1YPR057W 1026 nt9.12□□□□□ -0.95
YHC1Q05900 TSC10YBR265W 963 nt9.11□□□□□ -0.95
YHC1Q05900 TOA2YKL058W 369 nt9.1□□□□□ -0.95
YHC1Q05900 YLR279WYLR279W 390 nt9.1□□□□□ -0.95
YHC1Q05900 MSB4YOL112W 1479 nt9.06□□□□□ -0.96
YHC1Q05900 GND2YGR256W 1479 nt9.05□□□□□ -0.96
YHC1Q05900 YGR012WYGR012W 1182 nt9.05□□□□□ -0.96
YHC1Q05900 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.05□□□□□ -0.96
YHC1Q05900 OYE3YPL171C 1203 nt9.05□□□□□ -0.96
YHC1Q05900 YMR103CYMR103C 363 nt9.04□□□□□ -0.96
YHC1Q05900 SDH5YOL071W 489 nt9.04□□□□□ -0.96
YHC1Q05900 MEP3YPR138C 1470 nt9.03□□□□□ -0.96
YHC1Q05900 PET8YNL003C 855 nt9.02□□□□□ -0.97
YHC1Q05900 UGA4YDL210W 1716 nt9.02□□□□□ -0.97
YHC1Q05900 ILV3YJR016C 1758 nt9.01□□□□□ -0.97
YHC1Q05900 CWC15YDR163W 528 nt9□□□□□ -0.97
YHC1Q05900 YOR325WYOR325W 474 nt9□□□□□ -0.97
YHC1Q05900 HEL2YDR266C 1920 nt8.99□□□□□ -0.97
YHC1Q05900 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.99□□□□□ -0.97
YHC1Q05900 HOL1YNR055C 1761 nt8.99□□□□□ -0.97
YHC1Q05900 FCY21YER060W 1587 nt8.97□□□□□ -0.97
YHC1Q05900 MUP1YGR055W 1725 nt8.97□□□□□ -0.97
YHC1Q05900 GLR1YPL091W 1452 nt8.96□□□□□ -0.97
YHC1Q05900 RAD23YEL037C 1197 nt8.96□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 FMS1YMR020W 1527 nt8.95□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 CAB5YDR196C 726 nt8.95□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 FLR1YBR008C 1647 nt8.94□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 YNL024CYNL024C 741 nt8.94□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 ACH1YBL015W 1581 nt8.94□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 APT2YDR441C 546 nt8.93□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 SSN3YPL042C 1668 nt8.92□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 SAM2YDR502C 1155 nt8.92□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 OXA1YER154W 1209 nt8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34 ms