Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 TIR3YIL011W 810 nt9.87□□□□□ -0.83
TRM12Q04235 RTN2YDL204W 1182 nt9.86□□□□□ -0.83
TRM12Q04235 CYT2YKL087C 675 nt9.86□□□□□ -0.83
TRM12Q04235 COQ2YNR041C 1119 nt9.84□□□□□ -0.83
TRM12Q04235 ARP6YLR085C 1317 nt9.83□□□□□ -0.84
TRM12Q04235 POM34YLR018C 900 nt9.82□□□□□ -0.84
TRM12Q04235 PLB1YMR008C 1995 nt9.81□□□□□ -0.84
TRM12Q04235 YCR087WYCR087W 516 nt9.81□□□□□ -0.84
TRM12Q04235 PRO1YDR300C 1287 nt9.81□□□□□ -0.84
TRM12Q04235 TOM6YOR045W 186 nt9.8□□□□□ -0.84
TRM12Q04235 LSC2YGR244C 1284 nt9.77□□□□□ -0.85
TRM12Q04235 RBG1YAL036C 1110 nt9.77□□□□□ -0.85
TRM12Q04235 AIM45YPR004C 1035 nt9.77□□□□□ -0.85
TRM12Q04235 NDI1YML120C 1542 nt9.77□□□□□ -0.85
TRM12Q04235 MRP20YDR405W 792 nt9.75□□□□□ -0.85
TRM12Q04235 PEX2YJL210W 816 nt9.73□□□□□ -0.85
TRM12Q04235 GAP1YKR039W 1809 nt9.72□□□□□ -0.85
TRM12Q04235 GLR1YPL091W 1452 nt9.72□□□□□ -0.85
TRM12Q04235 ATG15YCR068W 1563 nt9.71□□□□□ -0.85
TRM12Q04235 YMR244WYMR244W 1068 nt9.71□□□□□ -0.86
TRM12Q04235 HIP1YGR191W 1812 nt9.7□□□□□ -0.86
TRM12Q04235 YML089CYML089C 369 nt9.69□□□□□ -0.86
TRM12Q04235 TIF6YPR016C 738 nt9.68□□□□□ -0.86
TRM12Q04235 UTR1YJR049C 1593 nt9.67□□□□□ -0.86
TRM12Q04235 RPL4BYDR012W 1089 nt9.65□□□□□ -0.86
TRM12Q04235 PRM5YIL117C 957 nt9.65□□□□□ -0.86
TRM12Q04235 RPL4AYBR031W 1089 nt9.65□□□□□ -0.86
TRM12Q04235 RPS14BYJL191W 417 nt9.64□□□□□ -0.87
TRM12Q04235 YAT1YAR035W 2064 nt9.63□□□□□ -0.87
TRM12Q04235 CLB6YGR109C 1143 nt9.6□□□□□ -0.87
TRM12Q04235 DIF1YLR437C 402 nt9.6□□□□□ -0.87
TRM12Q04235 UTH1YKR042W 1098 nt9.59□□□□□ -0.87
TRM12Q04235 HIF1YLL022C 1158 nt9.59□□□□□ -0.87
TRM12Q04235 NRT1YOR071C 1797 nt9.59□□□□□ -0.87
TRM12Q04235 CMP2YML057W 1815 nt9.59□□□□□ -0.88
TRM12Q04235 MET28YIR017C 564 nt9.57□□□□□ -0.88
TRM12Q04235 ALD4YOR374W 1560 nt9.57□□□□□ -0.88
TRM12Q04235 RBG2YGR173W 1107 nt9.55□□□□□ -0.88
TRM12Q04235 YMR226CYMR226C 804 nt9.53□□□□□ -0.88
TRM12Q04235 SDH5YOL071W 489 nt9.52□□□□□ -0.89
TRM12Q04235 YLR111WYLR111W 333 nt9.5□□□□□ -0.89
TRM12Q04235 ZTA1YBR046C 1005 nt9.5□□□□□ -0.89
TRM12Q04235 CAB5YDR196C 726 nt9.49□□□□□ -0.89
TRM12Q04235 YAR028WYAR028W 705 nt9.48□□□□□ -0.89
TRM12Q04235 MTG2YHR168W 1557 nt9.48□□□□□ -0.89
TRM12Q04235 YLR279WYLR279W 390 nt9.47□□□□□ -0.89
TRM12Q04235 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.46□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.46□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.46□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.46□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.46□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 TSC10YBR265W 963 nt9.46□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 YGR012WYGR012W 1182 nt9.45□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 SAM35YHR083W 990 nt9.45□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 FIT3YOR383C 615 nt9.44□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 MSB4YOL112W 1479 nt9.44□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 AKR2YOR034C 2250 nt9.43□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 INA1YLR413W 2028 nt9.43□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 RPC82YPR190C 1965 nt9.43□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 SPT20YOL148C 1815 nt9.42□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 RAD23YEL037C 1197 nt9.42□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 DBP1YPL119C 1854 nt9.42□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 Q0182Q0182 405 nt9.41□□□□□ -0.9
TRM12Q04235 ALP1YNL270C 1722 nt9.39□□□□□ -0.91
TRM12Q04235 HSL7YBR133C 2484 nt9.38□□□□□ -0.91
TRM12Q04235 ZRT3YKL175W 1512 nt9.38□□□□□ -0.91
TRM12Q04235 SED1YDR077W 1017 nt9.37□□□□□ -0.91
TRM12Q04235 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.36□□□□□ -0.91
TRM12Q04235 LIP1YMR298W 453 nt9.36□□□□□ -0.91
TRM12Q04235 YBL086CYBL086C 1401 nt9.36□□□□□ -0.91
TRM12Q04235 HXT1YHR094C 1713 nt9.36□□□□□ -0.91
TRM12Q04235 YPL251WYPL251W 303 nt9.34□□□□□ -0.91
TRM12Q04235 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.31□□□□□ -0.92
TRM12Q04235 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.31□□□□□ -0.92
TRM12Q04235 RIB3YDR487C 627 nt9.31□□□□□ -0.92
TRM12Q04235 SHY1YGR112W 1170 nt9.3□□□□□ -0.92
TRM12Q04235 UGA4YDL210W 1716 nt9.29□□□□□ -0.92
TRM12Q04235 SAM1YLR180W 1149 nt9.29□□□□□ -0.92
TRM12Q04235 YJL067WYJL067W 351 nt9.28□□□□□ -0.92
TRM12Q04235 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.28□□□□□ -0.92
TRM12Q04235 LEU9YOR108W 1815 nt9.28□□□□□ -0.92
TRM12Q04235 BRR1YPR057W 1026 nt9.26□□□□□ -0.93
TRM12Q04235 FCY21YER060W 1587 nt9.24□□□□□ -0.93
TRM12Q04235 UFO1YML088W 2007 nt9.24□□□□□ -0.93
TRM12Q04235 TOA2YKL058W 369 nt9.23□□□□□ -0.93
TRM12Q04235 RPM1RPM1 483 nt9.23□□□□□ -0.93
TRM12Q04235 YMR103CYMR103C 363 nt9.23□□□□□ -0.93
TRM12Q04235 MEP3YPR138C 1470 nt9.21□□□□□ -0.93
TRM12Q04235 GND1YHR183W 1470 nt9.21□□□□□ -0.94
TRM12Q04235 SMM1YNR015W 1155 nt9.2□□□□□ -0.94
TRM12Q04235 LOT5YKL183W 921 nt9.19□□□□□ -0.94
TRM12Q04235 GND2YGR256W 1479 nt9.19□□□□□ -0.94
TRM12Q04235 PRY1YJL079C 900 nt9.17□□□□□ -0.94
TRM12Q04235 URA6YKL024C 615 nt9.16□□□□□ -0.94
TRM12Q04235 APT2YDR441C 546 nt9.15□□□□□ -0.94
TRM12Q04235 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.15□□□□□ -0.94
TRM12Q04235 MUP1YGR055W 1725 nt9.14□□□□□ -0.95
TRM12Q04235 OYE3YPL171C 1203 nt9.13□□□□□ -0.95
TRM12Q04235 HOL1YNR055C 1761 nt9.12□□□□□ -0.95
TRM12Q04235 YPI1YFR003C 468 nt9.12□□□□□ -0.95
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