Protein–RNA interactions for Protein: Q02863

UBP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, yeastyeast

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP16Q02863 STR3YGL184C 1398 nt12.06□□□□□ -0.48
UBP16Q02863 TOM6YOR045W 186 nt12.06□□□□□ -0.48
UBP16Q02863 AQY2YLL052C 450 nt12.04□□□□□ -0.48
UBP16Q02863 PEX2YJL210W 816 nt12.03□□□□□ -0.48
UBP16Q02863 UTH1YKR042W 1098 nt12.03□□□□□ -0.48
UBP16Q02863 YGR012WYGR012W 1182 nt12.02□□□□□ -0.49
UBP16Q02863 ADH7YCR105W 1086 nt12□□□□□ -0.49
UBP16Q02863 TIR3YIL011W 810 nt12□□□□□ -0.49
UBP16Q02863 YLR279WYLR279W 390 nt12□□□□□ -0.49
UBP16Q02863 TSC10YBR265W 963 nt11.98□□□□□ -0.49
UBP16Q02863 RIB3YDR487C 627 nt11.97□□□□□ -0.49
UBP16Q02863 PAU15YIR041W 375 nt11.97□□□□□ -0.49
UBP16Q02863 HIP1YGR191W 1812 nt11.97□□□□□ -0.49
UBP16Q02863 FUN14YAL008W 597 nt11.95□□□□□ -0.5
UBP16Q02863 POM34YLR018C 900 nt11.95□□□□□ -0.5
UBP16Q02863 NRT1YOR071C 1797 nt11.95□□□□□ -0.5
UBP16Q02863 YCL074WYCL074W 927 nt11.94□□□□□ -0.5
UBP16Q02863 YJL195CYJL195C 702 nt11.94□□□□□ -0.5
UBP16Q02863 PRO1YDR300C 1287 nt11.93□□□□□ -0.5
UBP16Q02863 FUR4YBR021W 1902 nt11.88□□□□□ -0.51
UBP16Q02863 ADH1YOL086C 1047 nt11.86□□□□□ -0.51
UBP16Q02863 GPN2YOR262W 1044 nt11.86□□□□□ -0.51
UBP16Q02863 MSB4YOL112W 1479 nt11.85□□□□□ -0.51
UBP16Q02863 TIF6YPR016C 738 nt11.84□□□□□ -0.51
UBP16Q02863 MET28YIR017C 564 nt11.83□□□□□ -0.52
UBP16Q02863 YML089CYML089C 369 nt11.83□□□□□ -0.52
UBP16Q02863 ATG15YCR068W 1563 nt11.81□□□□□ -0.52
UBP16Q02863 LSC2YGR244C 1284 nt11.81□□□□□ -0.52
UBP16Q02863 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.79□□□□□ -0.52
UBP16Q02863 ARP6YLR085C 1317 nt11.79□□□□□ -0.52
UBP16Q02863 PLB1YMR008C 1995 nt11.74□□□□□ -0.53
UBP16Q02863 YPI1YFR003C 468 nt11.74□□□□□ -0.53
UBP16Q02863 LOT5YKL183W 921 nt11.73□□□□□ -0.53
UBP16Q02863 AAC1YMR056C 930 nt11.73□□□□□ -0.53
UBP16Q02863 GAP1YKR039W 1809 nt11.72□□□□□ -0.53
UBP16Q02863 YEL008WYEL008W 381 nt11.72□□□□□ -0.53
UBP16Q02863 CPD1YGR247W 720 nt11.71□□□□□ -0.53
UBP16Q02863 Q0182Q0182 405 nt11.7□□□□□ -0.54
UBP16Q02863 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.7□□□□□ -0.54
UBP16Q02863 RTN2YDL204W 1182 nt11.69□□□□□ -0.54
UBP16Q02863 ESS1YJR017C 513 nt11.69□□□□□ -0.54
UBP16Q02863 FIT3YOR383C 615 nt11.69□□□□□ -0.54
UBP16Q02863 GND1YHR183W 1470 nt11.69□□□□□ -0.54
UBP16Q02863 PAC11YDR488C 1602 nt11.65□□□□□ -0.54
UBP16Q02863 APT2YDR441C 546 nt11.65□□□□□ -0.54
UBP16Q02863 YKR005CYKR005C 1578 nt11.64□□□□□ -0.55
UBP16Q02863 YGR259CYGR259C 441 nt11.61□□□□□ -0.55
UBP16Q02863 ZTA1YBR046C 1005 nt11.61□□□□□ -0.55
UBP16Q02863 UTR1YJR049C 1593 nt11.6□□□□□ -0.55
UBP16Q02863 DIF1YLR437C 402 nt11.59□□□□□ -0.55
UBP16Q02863 HSP60YLR259C 1719 nt11.59□□□□□ -0.55
UBP16Q02863 SMM1YNR015W 1155 nt11.56□□□□□ -0.56
UBP16Q02863 PRP4YPR178W 1398 nt11.54□□□□□ -0.56
UBP16Q02863 RIB2YOL066C 1776 nt11.54□□□□□ -0.56
UBP16Q02863 AKR2YOR034C 2250 nt11.53□□□□□ -0.56
UBP16Q02863 MTG2YHR168W 1557 nt11.53□□□□□ -0.56
UBP16Q02863 SEN2YLR105C 1134 nt11.52□□□□□ -0.57
UBP16Q02863 YAR028WYAR028W 705 nt11.5□□□□□ -0.57
UBP16Q02863 LSB3YFR024C-A 1380 nt11.5□□□□□ -0.57
UBP16Q02863 ALP1YNL270C 1722 nt11.49□□□□□ -0.57
UBP16Q02863 PUP1YOR157C 786 nt11.49□□□□□ -0.57
UBP16Q02863 DPS1YLL018C 1674 nt11.47□□□□□ -0.57
UBP16Q02863 PRM5YIL117C 957 nt11.47□□□□□ -0.57
UBP16Q02863 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.44□□□□□ -0.58
UBP16Q02863 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.44□□□□□ -0.58
UBP16Q02863 NAP1YKR048C 1254 nt11.44□□□□□ -0.58
UBP16Q02863 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.44□□□□□ -0.58
UBP16Q02863 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.44□□□□□ -0.58
UBP16Q02863 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.44□□□□□ -0.58
UBP16Q02863 FCY21YER060W 1587 nt11.43□□□□□ -0.58
UBP16Q02863 PAU5YFL020C 369 nt11.42□□□□□ -0.58
UBP16Q02863 PGC1YPL206C 966 nt11.42□□□□□ -0.58
UBP16Q02863 PRY1YJL079C 900 nt11.39□□□□□ -0.59
UBP16Q02863 SNF1YDR477W 1902 nt11.37□□□□□ -0.59
UBP16Q02863 VRG4YGL225W 1014 nt11.37□□□□□ -0.59
UBP16Q02863 ALD4YOR374W 1560 nt11.37□□□□□ -0.59
UBP16Q02863 UGA4YDL210W 1716 nt11.36□□□□□ -0.59
UBP16Q02863 BMT6YLR063W 1098 nt11.36□□□□□ -0.59
UBP16Q02863 YJL055WYJL055W 738 nt11.35□□□□□ -0.59
UBP16Q02863 HXT12YIL170W 1374 nt11.35□□□□□ -0.59
UBP16Q02863 YBR232CYBR232C 360 nt11.34□□□□□ -0.59
UBP16Q02863 BOR1YNL275W 1731 nt11.32□□□□□ -0.6
UBP16Q02863 SED1YDR077W 1017 nt11.31□□□□□ -0.6
UBP16Q02863 IRC24YIR036C 792 nt11.31□□□□□ -0.6
UBP16Q02863 YJL064WYJL064W 396 nt11.31□□□□□ -0.6
UBP16Q02863 YPL251WYPL251W 303 nt11.28□□□□□ -0.6
UBP16Q02863 SAM35YHR083W 990 nt11.27□□□□□ -0.61
UBP16Q02863 STP3YLR375W 1032 nt11.27□□□□□ -0.61
UBP16Q02863 LIP1YMR298W 453 nt11.26□□□□□ -0.61
UBP16Q02863 DBP1YPL119C 1854 nt11.24□□□□□ -0.61
UBP16Q02863 PAU19YMR325W 375 nt11.24□□□□□ -0.61
UBP16Q02863 YBL086CYBL086C 1401 nt11.24□□□□□ -0.61
UBP16Q02863 CCT5YJR064W 1689 nt11.24□□□□□ -0.61
UBP16Q02863 HIF1YLL022C 1158 nt11.21□□□□□ -0.61
UBP16Q02863 SLG1YOR008C 1137 nt11.21□□□□□ -0.61
UBP16Q02863 YMR103CYMR103C 363 nt11.19□□□□□ -0.62
UBP16Q02863 HXT1YHR094C 1713 nt11.18□□□□□ -0.62
UBP16Q02863 BRR1YPR057W 1026 nt11.17□□□□□ -0.62
UBP16Q02863 MEP3YPR138C 1470 nt11.17□□□□□ -0.62
UBP16Q02863 YJR114WYJR114W 393 nt11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.6 ms