Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pax5Q02650 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pax5Q02650 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pax5Q02650 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pax5Q02650 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pax5Q02650 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pax5Q02650 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pax5Q02650 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax5Q02650 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax5Q02650 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pax5Q02650 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pax5Q02650 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pax5Q02650 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pax5Q02650 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pax5Q02650 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pax5Q02650 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pax5Q02650 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pax5Q02650 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pax5Q02650 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pax5Q02650 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pax5Q02650 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pax5Q02650 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pax5Q02650 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pax5Q02650 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pax5Q02650 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pax5Q02650 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pax5Q02650 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pax5Q02650 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pax5Q02650 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pax5Q02650 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pax5Q02650 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pax5Q02650 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pax5Q02650 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pax5Q02650 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pax5Q02650 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pax5Q02650 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pax5Q02650 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pax5Q02650 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pax5Q02650 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pax5Q02650 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pax5Q02650 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pax5Q02650 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pax5Q02650 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pax5Q02650 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pax5Q02650 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pax5Q02650 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pax5Q02650 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pax5Q02650 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pax5Q02650 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pax5Q02650 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pax5Q02650 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms