Protein–RNA interactions for Protein: P53047

RTA1, Protein RTA1, yeastyeast

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTA1P53047 YSR3YKR053C 1215 nt10.19□□□□□ -0.78
RTA1P53047 MSF1YPR047W 1410 nt10.18□□□□□ -0.78
RTA1P53047 SFA1YDL168W 1161 nt10.18□□□□□ -0.78
RTA1P53047 POM34YLR018C 900 nt10.18□□□□□ -0.78
RTA1P53047 GAP1YKR039W 1809 nt10.18□□□□□ -0.78
RTA1P53047 YML089CYML089C 369 nt10.16□□□□□ -0.78
RTA1P53047 NAR1YNL240C 1476 nt10.16□□□□□ -0.78
RTA1P53047 ATG15YCR068W 1563 nt10.15□□□□□ -0.78
RTA1P53047 Q0010Q0010 387 nt10.15□□□□□ -0.78
RTA1P53047 YCR087WYCR087W 516 nt10.14□□□□□ -0.79
RTA1P53047 CLB6YGR109C 1143 nt10.12□□□□□ -0.79
RTA1P53047 TOM6YOR045W 186 nt10.12□□□□□ -0.79
RTA1P53047 MET8YBR213W 825 nt10.12□□□□□ -0.79
RTA1P53047 UTR1YJR049C 1593 nt10.12□□□□□ -0.79
RTA1P53047 MCH5YOR306C 1566 nt10.12□□□□□ -0.79
RTA1P53047 MRP20YDR405W 792 nt10.11□□□□□ -0.79
RTA1P53047 SAM35YHR083W 990 nt10.11□□□□□ -0.79
RTA1P53047 PRM5YIL117C 957 nt10.11□□□□□ -0.79
RTA1P53047 YGL034CYGL034C 366 nt10.08□□□□□ -0.8
RTA1P53047 XYL2YLR070C 1071 nt10.08□□□□□ -0.8
RTA1P53047 ALD4YOR374W 1560 nt10.08□□□□□ -0.8
RTA1P53047 PBP1YGR178C 2169 nt10.07□□□□□ -0.8
RTA1P53047 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.07□□□□□ -0.8
RTA1P53047 CYT2YKL087C 675 nt10.07□□□□□ -0.8
RTA1P53047 COQ2YNR041C 1119 nt10.07□□□□□ -0.8
RTA1P53047 PEX2YJL210W 816 nt10.05□□□□□ -0.8
RTA1P53047 YGR139WYGR139W 339 nt10.04□□□□□ -0.8
RTA1P53047 HIF1YLL022C 1158 nt10.03□□□□□ -0.8
RTA1P53047 AIM45YPR004C 1035 nt10.03□□□□□ -0.8
RTA1P53047 HIP1YGR191W 1812 nt10.01□□□□□ -0.81
RTA1P53047 TIF6YPR016C 738 nt10.01□□□□□ -0.81
RTA1P53047 DIF1YLR437C 402 nt10□□□□□ -0.81
RTA1P53047 RPL4BYDR012W 1089 nt9.99□□□□□ -0.81
RTA1P53047 YJR154WYJR154W 1041 nt9.99□□□□□ -0.81
RTA1P53047 RPL4AYBR031W 1089 nt9.99□□□□□ -0.81
RTA1P53047 MET28YIR017C 564 nt9.98□□□□□ -0.81
RTA1P53047 UTH1YKR042W 1098 nt9.98□□□□□ -0.81
RTA1P53047 NRT1YOR071C 1797 nt9.96□□□□□ -0.82
RTA1P53047 RBG1YAL036C 1110 nt9.95□□□□□ -0.82
RTA1P53047 YAR028WYAR028W 705 nt9.91□□□□□ -0.82
RTA1P53047 NDI1YML120C 1542 nt9.89□□□□□ -0.83
RTA1P53047 RPS14BYJL191W 417 nt9.89□□□□□ -0.83
RTA1P53047 FIT3YOR383C 615 nt9.88□□□□□ -0.83
RTA1P53047 HXT1YHR094C 1713 nt9.87□□□□□ -0.83
RTA1P53047 ZRT3YKL175W 1512 nt9.87□□□□□ -0.83
RTA1P53047 DBP1YPL119C 1854 nt9.85□□□□□ -0.83
RTA1P53047 SED1YDR077W 1017 nt9.84□□□□□ -0.83
RTA1P53047 LIP1YMR298W 453 nt9.83□□□□□ -0.84
RTA1P53047 MTG2YHR168W 1557 nt9.83□□□□□ -0.84
RTA1P53047 ALP1YNL270C 1722 nt9.82□□□□□ -0.84
RTA1P53047 AKR2YOR034C 2250 nt9.82□□□□□ -0.84
RTA1P53047 TSC10YBR265W 963 nt9.8□□□□□ -0.84
RTA1P53047 YAT1YAR035W 2064 nt9.79□□□□□ -0.84
RTA1P53047 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.79□□□□□ -0.84
RTA1P53047 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.79□□□□□ -0.84
RTA1P53047 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.79□□□□□ -0.84
RTA1P53047 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.79□□□□□ -0.84
RTA1P53047 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.79□□□□□ -0.84
RTA1P53047 SDH5YOL071W 489 nt9.79□□□□□ -0.84
RTA1P53047 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.79□□□□□ -0.84
RTA1P53047 ZTA1YBR046C 1005 nt9.77□□□□□ -0.85
RTA1P53047 INA1YLR413W 2028 nt9.76□□□□□ -0.85
RTA1P53047 YBL086CYBL086C 1401 nt9.75□□□□□ -0.85
RTA1P53047 SHY1YGR112W 1170 nt9.75□□□□□ -0.85
RTA1P53047 SAM1YLR180W 1149 nt9.75□□□□□ -0.85
RTA1P53047 BSP1YPR171W 1731 nt9.72□□□□□ -0.85
RTA1P53047 CMP2YML057W 1815 nt9.72□□□□□ -0.85
RTA1P53047 GLR1YPL091W 1452 nt9.72□□□□□ -0.85
RTA1P53047 YGR012WYGR012W 1182 nt9.71□□□□□ -0.86
RTA1P53047 CSM2YIL132C 642 nt9.7□□□□□ -0.86
RTA1P53047 YJL067WYJL067W 351 nt9.7□□□□□ -0.86
RTA1P53047 TOA2YKL058W 369 nt9.7□□□□□ -0.86
RTA1P53047 YLR279WYLR279W 390 nt9.7□□□□□ -0.86
RTA1P53047 BRR1YPR057W 1026 nt9.69□□□□□ -0.86
RTA1P53047 LEU9YOR108W 1815 nt9.68□□□□□ -0.86
RTA1P53047 YPL251WYPL251W 303 nt9.67□□□□□ -0.86
RTA1P53047 URA6YKL024C 615 nt9.66□□□□□ -0.86
RTA1P53047 YLR111WYLR111W 333 nt9.66□□□□□ -0.86
RTA1P53047 RAD23YEL037C 1197 nt9.65□□□□□ -0.86
RTA1P53047 SPT20YOL148C 1815 nt9.65□□□□□ -0.86
RTA1P53047 RPC82YPR190C 1965 nt9.64□□□□□ -0.87
RTA1P53047 MSB4YOL112W 1479 nt9.64□□□□□ -0.87
RTA1P53047 SBA1YKL117W 651 nt9.63□□□□□ -0.87
RTA1P53047 PAB1YER165W 1734 nt9.62□□□□□ -0.87
RTA1P53047 MEP3YPR138C 1470 nt9.62□□□□□ -0.87
RTA1P53047 UFO1YML088W 2007 nt9.61□□□□□ -0.87
RTA1P53047 GND2YGR256W 1479 nt9.61□□□□□ -0.87
RTA1P53047 RSC4YKR008W 1878 nt9.61□□□□□ -0.87
RTA1P53047 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.6□□□□□ -0.87
RTA1P53047 YMR103CYMR103C 363 nt9.6□□□□□ -0.87
RTA1P53047 OYE3YPL171C 1203 nt9.6□□□□□ -0.87
RTA1P53047 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.6□□□□□ -0.87
RTA1P53047 YMR244WYMR244W 1068 nt9.59□□□□□ -0.87
RTA1P53047 PET8YNL003C 855 nt9.59□□□□□ -0.87
RTA1P53047 YMR226CYMR226C 804 nt9.58□□□□□ -0.88
RTA1P53047 CWC15YDR163W 528 nt9.57□□□□□ -0.88
RTA1P53047 SAM2YDR502C 1155 nt9.57□□□□□ -0.88
RTA1P53047 APT2YDR441C 546 nt9.56□□□□□ -0.88
RTA1P53047 UGA4YDL210W 1716 nt9.55□□□□□ -0.88
RTA1P53047 RIB3YDR487C 627 nt9.54□□□□□ -0.88
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