Protein–RNA interactions for Protein: P53040

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, yeastyeast

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF6P53040 RPM1RPM1 483 nt9.95□□□□□ -0.82
TAF6P53040 POM34YLR018C 900 nt9.94□□□□□ -0.82
TAF6P53040 ATG15YCR068W 1563 nt9.92□□□□□ -0.82
TAF6P53040 YFR018CYFR018C 1092 nt9.9□□□□□ -0.82
TAF6P53040 YML089CYML089C 369 nt9.89□□□□□ -0.83
TAF6P53040 YDR094WYDR094W 336 nt9.88□□□□□ -0.83
TAF6P53040 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.86□□□□□ -0.83
TAF6P53040 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.86□□□□□ -0.83
TAF6P53040 YDR010CYDR010C 333 nt9.86□□□□□ -0.83
TAF6P53040 UBX6YJL048C 1191 nt9.86□□□□□ -0.83
TAF6P53040 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.85□□□□□ -0.83
TAF6P53040 DIF1YLR437C 402 nt9.85□□□□□ -0.83
TAF6P53040 SFA1YDL168W 1161 nt9.84□□□□□ -0.83
TAF6P53040 SHB17YKR043C 816 nt9.84□□□□□ -0.83
TAF6P53040 TOM6YOR045W 186 nt9.84□□□□□ -0.83
TAF6P53040 HXT1YHR094C 1713 nt9.83□□□□□ -0.84
TAF6P53040 YJL067WYJL067W 351 nt9.83□□□□□ -0.84
TAF6P53040 DBP1YPL119C 1854 nt9.83□□□□□ -0.84
TAF6P53040 PRE6YOL038W 765 nt9.81□□□□□ -0.84
TAF6P53040 RET2YFR051C 1641 nt9.78□□□□□ -0.84
TAF6P53040 SHY1YGR112W 1170 nt9.76□□□□□ -0.85
TAF6P53040 PEX2YJL210W 816 nt9.74□□□□□ -0.85
TAF6P53040 TIF6YPR016C 738 nt9.74□□□□□ -0.85
TAF6P53040 RRT5YFR032C 870 nt9.73□□□□□ -0.85
TAF6P53040 MUP1YGR055W 1725 nt9.73□□□□□ -0.85
TAF6P53040 PHO89YBR296C 1725 nt9.73□□□□□ -0.85
TAF6P53040 MIR1YJR077C 936 nt9.72□□□□□ -0.85
TAF6P53040 RIM8YGL045W 1629 nt9.71□□□□□ -0.85
TAF6P53040 LIP1YMR298W 453 nt9.71□□□□□ -0.86
TAF6P53040 UBA4YHR111W 1323 nt9.71□□□□□ -0.86
TAF6P53040 HIP1YGR191W 1812 nt9.7□□□□□ -0.86
TAF6P53040 PAU16YKL224C 372 nt9.69□□□□□ -0.86
TAF6P53040 YAR028WYAR028W 705 nt9.69□□□□□ -0.86
TAF6P53040 HEL2YDR266C 1920 nt9.68□□□□□ -0.86
TAF6P53040 HOL1YNR055C 1761 nt9.68□□□□□ -0.86
TAF6P53040 YBL086CYBL086C 1401 nt9.68□□□□□ -0.86
TAF6P53040 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.68□□□□□ -0.86
TAF6P53040 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.68□□□□□ -0.86
TAF6P53040 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.68□□□□□ -0.86
TAF6P53040 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.68□□□□□ -0.86
TAF6P53040 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.68□□□□□ -0.86
TAF6P53040 SED1YDR077W 1017 nt9.67□□□□□ -0.86
TAF6P53040 MET28YIR017C 564 nt9.66□□□□□ -0.86
TAF6P53040 YNL024CYNL024C 741 nt9.66□□□□□ -0.86
TAF6P53040 ILV3YJR016C 1758 nt9.65□□□□□ -0.86
TAF6P53040 COQ2YNR041C 1119 nt9.65□□□□□ -0.86
TAF6P53040 YGL114WYGL114W 2178 nt9.64□□□□□ -0.87
TAF6P53040 URA6YKL024C 615 nt9.64□□□□□ -0.87
TAF6P53040 YSR3YKR053C 1215 nt9.64□□□□□ -0.87
TAF6P53040 MRP20YDR405W 792 nt9.63□□□□□ -0.87
TAF6P53040 YOR325WYOR325W 474 nt9.63□□□□□ -0.87
TAF6P53040 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.62□□□□□ -0.87
TAF6P53040 MTG2YHR168W 1557 nt9.62□□□□□ -0.87
TAF6P53040 THI74YDR438W 1113 nt9.61□□□□□ -0.87
TAF6P53040 SAM1YLR180W 1149 nt9.61□□□□□ -0.87
TAF6P53040 CWC15YDR163W 528 nt9.6□□□□□ -0.87
TAF6P53040 LEU9YOR108W 1815 nt9.59□□□□□ -0.87
TAF6P53040 YCR087WYCR087W 516 nt9.59□□□□□ -0.87
TAF6P53040 NRT1YOR071C 1797 nt9.59□□□□□ -0.87
TAF6P53040 UFO1YML088W 2007 nt9.58□□□□□ -0.88
TAF6P53040 TOA2YKL058W 369 nt9.57□□□□□ -0.88
TAF6P53040 BRR1YPR057W 1026 nt9.57□□□□□ -0.88
TAF6P53040 AKR2YOR034C 2250 nt9.57□□□□□ -0.88
TAF6P53040 UTH1YKR042W 1098 nt9.56□□□□□ -0.88
TAF6P53040 ALP1YNL270C 1722 nt9.56□□□□□ -0.88
TAF6P53040 CLB6YGR109C 1143 nt9.55□□□□□ -0.88
TAF6P53040 XYL2YLR070C 1071 nt9.55□□□□□ -0.88
TAF6P53040 RPL4BYDR012W 1089 nt9.54□□□□□ -0.88
TAF6P53040 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.54□□□□□ -0.88
TAF6P53040 PET8YNL003C 855 nt9.54□□□□□ -0.88
TAF6P53040 RPL4AYBR031W 1089 nt9.54□□□□□ -0.88
TAF6P53040 ZTA1YBR046C 1005 nt9.54□□□□□ -0.88
TAF6P53040 OYE3YPL171C 1203 nt9.54□□□□□ -0.88
TAF6P53040 OPI10YOL032W 741 nt9.53□□□□□ -0.88
TAF6P53040 FIT3YOR383C 615 nt9.53□□□□□ -0.88
TAF6P53040 YPL251WYPL251W 303 nt9.53□□□□□ -0.88
TAF6P53040 GND2YGR256W 1479 nt9.52□□□□□ -0.89
TAF6P53040 CCT2YIL142W 1584 nt9.51□□□□□ -0.89
TAF6P53040 NAT4YMR069W 858 nt9.5□□□□□ -0.89
TAF6P53040 COQ8YGL119W 1506 nt9.5□□□□□ -0.89
TAF6P53040 HIS2YFR025C 1008 nt9.49□□□□□ -0.89
TAF6P53040 ARO8YGL202W 1503 nt9.49□□□□□ -0.89
TAF6P53040 MSF1YPR047W 1410 nt9.48□□□□□ -0.89
TAF6P53040 YGL034CYGL034C 366 nt9.48□□□□□ -0.89
TAF6P53040 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.48□□□□□ -0.89
TAF6P53040 AIM45YPR004C 1035 nt9.47□□□□□ -0.89
TAF6P53040 RPS14BYJL191W 417 nt9.46□□□□□ -0.9
TAF6P53040 YMR103CYMR103C 363 nt9.46□□□□□ -0.9
TAF6P53040 MEP3YPR138C 1470 nt9.46□□□□□ -0.9
TAF6P53040 BET2YPR176C 978 nt9.45□□□□□ -0.9
TAF6P53040 SBA1YKL117W 651 nt9.44□□□□□ -0.9
TAF6P53040 UGP1YKL035W 1500 nt9.43□□□□□ -0.9
TAF6P53040 FMS1YMR020W 1527 nt9.43□□□□□ -0.9
TAF6P53040 KES1YPL145C 1305 nt9.43□□□□□ -0.9
TAF6P53040 SAM2YDR502C 1155 nt9.43□□□□□ -0.9
TAF6P53040 SPP2YOR148C 558 nt9.43□□□□□ -0.9
TAF6P53040 YMR209CYMR209C 1374 nt9.41□□□□□ -0.9
TAF6P53040 RSC8YFR037C 1674 nt9.41□□□□□ -0.9
TAF6P53040 ACH1YBL015W 1581 nt9.41□□□□□ -0.9
TAF6P53040 LSB6YJL100W 1824 nt9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.9 ms