Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 LSC2YGR244C 1284 nt11.52□□□□□ -0.57
VID28P40547 IRC24YIR036C 792 nt11.5□□□□□ -0.57
VID28P40547 TOM6YOR045W 186 nt11.5□□□□□ -0.57
VID28P40547 ALG12YNR030W 1656 nt11.49□□□□□ -0.57
VID28P40547 MCH5YOR306C 1566 nt11.46□□□□□ -0.57
VID28P40547 GAP1YKR039W 1809 nt11.46□□□□□ -0.58
VID28P40547 BIO5YNR056C 1686 nt11.46□□□□□ -0.58
VID28P40547 YCR087WYCR087W 516 nt11.45□□□□□ -0.58
VID28P40547 AIM45YPR004C 1035 nt11.45□□□□□ -0.58
VID28P40547 MRP20YDR405W 792 nt11.43□□□□□ -0.58
VID28P40547 YML089CYML089C 369 nt11.42□□□□□ -0.58
VID28P40547 HIP1YGR191W 1812 nt11.42□□□□□ -0.58
VID28P40547 ATG15YCR068W 1563 nt11.41□□□□□ -0.58
VID28P40547 PEX2YJL210W 816 nt11.41□□□□□ -0.58
VID28P40547 RBG1YAL036C 1110 nt11.41□□□□□ -0.58
VID28P40547 UTR1YJR049C 1593 nt11.41□□□□□ -0.58
VID28P40547 TIF6YPR016C 738 nt11.38□□□□□ -0.59
VID28P40547 PRM5YIL117C 957 nt11.36□□□□□ -0.59
VID28P40547 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.35□□□□□ -0.59
VID28P40547 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.35□□□□□ -0.59
VID28P40547 NDI1YML120C 1542 nt11.33□□□□□ -0.6
VID28P40547 RPL4BYDR012W 1089 nt11.32□□□□□ -0.6
VID28P40547 RPL4AYBR031W 1089 nt11.32□□□□□ -0.6
VID28P40547 RPS14BYJL191W 417 nt11.31□□□□□ -0.6
VID28P40547 DIF1YLR437C 402 nt11.31□□□□□ -0.6
VID28P40547 PBP1YGR178C 2169 nt11.28□□□□□ -0.6
VID28P40547 UTH1YKR042W 1098 nt11.27□□□□□ -0.61
VID28P40547 MET28YIR017C 564 nt11.26□□□□□ -0.61
VID28P40547 NRT1YOR071C 1797 nt11.26□□□□□ -0.61
VID28P40547 CLB6YGR109C 1143 nt11.24□□□□□ -0.61
VID28P40547 HIF1YLL022C 1158 nt11.22□□□□□ -0.61
VID28P40547 GLR1YPL091W 1452 nt11.2□□□□□ -0.62
VID28P40547 YMR244WYMR244W 1068 nt11.2□□□□□ -0.62
VID28P40547 ALD4YOR374W 1560 nt11.2□□□□□ -0.62
VID28P40547 MTG2YHR168W 1557 nt11.17□□□□□ -0.62
VID28P40547 NAR1YNL240C 1476 nt11.17□□□□□ -0.62
VID28P40547 YAR028WYAR028W 705 nt11.16□□□□□ -0.62
VID28P40547 ZTA1YBR046C 1005 nt11.15□□□□□ -0.62
VID28P40547 DBP1YPL119C 1854 nt11.14□□□□□ -0.63
VID28P40547 SAM35YHR083W 990 nt11.13□□□□□ -0.63
VID28P40547 CYT2YKL087C 675 nt11.12□□□□□ -0.63
VID28P40547 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.11□□□□□ -0.63
VID28P40547 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.11□□□□□ -0.63
VID28P40547 YLR279WYLR279W 390 nt11.11□□□□□ -0.63
VID28P40547 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.11□□□□□ -0.63
VID28P40547 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.11□□□□□ -0.63
VID28P40547 FIT3YOR383C 615 nt11.11□□□□□ -0.63
VID28P40547 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.11□□□□□ -0.63
VID28P40547 CAB5YDR196C 726 nt11.1□□□□□ -0.63
VID28P40547 TSC10YBR265W 963 nt11.1□□□□□ -0.63
VID28P40547 YGR012WYGR012W 1182 nt11.08□□□□□ -0.64
VID28P40547 SDH5YOL071W 489 nt11.07□□□□□ -0.64
VID28P40547 ALP1YNL270C 1722 nt11.06□□□□□ -0.64
VID28P40547 MSB4YOL112W 1479 nt11.06□□□□□ -0.64
VID28P40547 AKR2YOR034C 2250 nt11.06□□□□□ -0.64
VID28P40547 YBL086CYBL086C 1401 nt11.03□□□□□ -0.64
VID28P40547 SED1YDR077W 1017 nt11.03□□□□□ -0.64
VID28P40547 HXT1YHR094C 1713 nt11.02□□□□□ -0.65
VID28P40547 RAD23YEL037C 1197 nt11□□□□□ -0.65
VID28P40547 LIP1YMR298W 453 nt11□□□□□ -0.65
VID28P40547 YAT1YAR035W 2064 nt10.98□□□□□ -0.65
VID28P40547 RBG2YGR173W 1107 nt10.98□□□□□ -0.65
VID28P40547 YPL251WYPL251W 303 nt10.98□□□□□ -0.65
VID28P40547 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.97□□□□□ -0.65
VID28P40547 SHY1YGR112W 1170 nt10.96□□□□□ -0.65
VID28P40547 YLR111WYLR111W 333 nt10.96□□□□□ -0.65
VID28P40547 YMR226CYMR226C 804 nt10.96□□□□□ -0.65
VID28P40547 LEU9YOR108W 1815 nt10.95□□□□□ -0.66
VID28P40547 RIB3YDR487C 627 nt10.93□□□□□ -0.66
VID28P40547 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.93□□□□□ -0.66
VID28P40547 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.93□□□□□ -0.66
VID28P40547 ZRT3YKL175W 1512 nt10.92□□□□□ -0.66
VID28P40547 UGA4YDL210W 1716 nt10.92□□□□□ -0.66
VID28P40547 UFO1YML088W 2007 nt10.91□□□□□ -0.66
VID28P40547 BRR1YPR057W 1026 nt10.89□□□□□ -0.67
VID28P40547 FCY21YER060W 1587 nt10.88□□□□□ -0.67
VID28P40547 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.88□□□□□ -0.67
VID28P40547 YJL067WYJL067W 351 nt10.87□□□□□ -0.67
VID28P40547 SAM1YLR180W 1149 nt10.86□□□□□ -0.67
VID28P40547 TOA2YKL058W 369 nt10.84□□□□□ -0.67
VID28P40547 YMR103CYMR103C 363 nt10.84□□□□□ -0.67
VID28P40547 MEP3YPR138C 1470 nt10.82□□□□□ -0.68
VID28P40547 URA6YKL024C 615 nt10.81□□□□□ -0.68
VID28P40547 GND2YGR256W 1479 nt10.81□□□□□ -0.68
VID28P40547 GND1YHR183W 1470 nt10.81□□□□□ -0.68
VID28P40547 RPC82YPR190C 1965 nt10.79□□□□□ -0.68
VID28P40547 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.78□□□□□ -0.68
VID28P40547 SMM1YNR015W 1155 nt10.78□□□□□ -0.68
VID28P40547 APT2YDR441C 546 nt10.76□□□□□ -0.69
VID28P40547 LOT5YKL183W 921 nt10.76□□□□□ -0.69
VID28P40547 PRY1YJL079C 900 nt10.75□□□□□ -0.69
VID28P40547 OYE3YPL171C 1203 nt10.75□□□□□ -0.69
VID28P40547 INA1YLR413W 2028 nt10.7□□□□□ -0.7
VID28P40547 SSN3YPL042C 1668 nt10.7□□□□□ -0.7
VID28P40547 CSM1YCR086W 573 nt10.7□□□□□ -0.7
VID28P40547 FLR1YBR008C 1647 nt10.69□□□□□ -0.7
VID28P40547 PET8YNL003C 855 nt10.68□□□□□ -0.7
VID28P40547 BNI5YNL166C 1347 nt10.67□□□□□ -0.7
VID28P40547 CMP2YML057W 1815 nt10.67□□□□□ -0.7
VID28P40547 MSC1YML128C 1542 nt10.65□□□□□ -0.7
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