Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 PHO89YBR296C 1725 nt8.43□□□□□ -1.06
CCS1P40202 PRM5YIL117C 957 nt8.42□□□□□ -1.06
CCS1P40202 YML089CYML089C 369 nt8.42□□□□□ -1.06
CCS1P40202 NAT4YMR069W 858 nt8.42□□□□□ -1.06
CCS1P40202 PBP1YGR178C 2169 nt8.42□□□□□ -1.06
CCS1P40202 UTR1YJR049C 1593 nt8.41□□□□□ -1.06
CCS1P40202 SFA1YDL168W 1161 nt8.41□□□□□ -1.06
CCS1P40202 SAM35YHR083W 990 nt8.41□□□□□ -1.06
CCS1P40202 YSR3YKR053C 1215 nt8.41□□□□□ -1.06
CCS1P40202 ALD4YOR374W 1560 nt8.4□□□□□ -1.06
CCS1P40202 TOM6YOR045W 186 nt8.38□□□□□ -1.07
CCS1P40202 MSF1YPR047W 1410 nt8.37□□□□□ -1.07
CCS1P40202 YCR087WYCR087W 516 nt8.36□□□□□ -1.07
CCS1P40202 HIF1YLL022C 1158 nt8.36□□□□□ -1.07
CCS1P40202 MRP20YDR405W 792 nt8.35□□□□□ -1.07
CCS1P40202 RPM1RPM1 483 nt8.35□□□□□ -1.07
CCS1P40202 PEX2YJL210W 816 nt8.32□□□□□ -1.08
CCS1P40202 XYL2YLR070C 1071 nt8.32□□□□□ -1.08
CCS1P40202 COQ2YNR041C 1119 nt8.32□□□□□ -1.08
CCS1P40202 YGL034CYGL034C 366 nt8.3□□□□□ -1.08
CCS1P40202 DIF1YLR437C 402 nt8.29□□□□□ -1.08
CCS1P40202 CLB6YGR109C 1143 nt8.28□□□□□ -1.08
CCS1P40202 TIF6YPR016C 738 nt8.28□□□□□ -1.08
CCS1P40202 HIP1YGR191W 1812 nt8.27□□□□□ -1.09
CCS1P40202 MET28YIR017C 564 nt8.26□□□□□ -1.09
CCS1P40202 RPL4BYDR012W 1089 nt8.25□□□□□ -1.09
CCS1P40202 RPL4AYBR031W 1089 nt8.25□□□□□ -1.09
CCS1P40202 AIM45YPR004C 1035 nt8.25□□□□□ -1.09
CCS1P40202 UTH1YKR042W 1098 nt8.24□□□□□ -1.09
CCS1P40202 NRT1YOR071C 1797 nt8.24□□□□□ -1.09
CCS1P40202 ZRT3YKL175W 1512 nt8.23□□□□□ -1.09
CCS1P40202 YAR028WYAR028W 705 nt8.22□□□□□ -1.09
CCS1P40202 HXT1YHR094C 1713 nt8.22□□□□□ -1.09
CCS1P40202 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.2□□□□□ -1.1
CCS1P40202 RBG1YAL036C 1110 nt8.2□□□□□ -1.1
CCS1P40202 YAT1YAR035W 2064 nt8.2□□□□□ -1.1
CCS1P40202 CMP2YML057W 1815 nt8.18□□□□□ -1.1
CCS1P40202 DBP1YPL119C 1854 nt8.18□□□□□ -1.1
CCS1P40202 INA1YLR413W 2028 nt8.17□□□□□ -1.1
CCS1P40202 LIP1YMR298W 453 nt8.17□□□□□ -1.1
CCS1P40202 FIT3YOR383C 615 nt8.17□□□□□ -1.1
CCS1P40202 NDI1YML120C 1542 nt8.17□□□□□ -1.1
CCS1P40202 SED1YDR077W 1017 nt8.16□□□□□ -1.1
CCS1P40202 RPS14BYJL191W 417 nt8.16□□□□□ -1.1
CCS1P40202 MTG2YHR168W 1557 nt8.14□□□□□ -1.11
CCS1P40202 ALP1YNL270C 1722 nt8.14□□□□□ -1.11
CCS1P40202 AKR2YOR034C 2250 nt8.14□□□□□ -1.11
CCS1P40202 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.13□□□□□ -1.11
CCS1P40202 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.13□□□□□ -1.11
CCS1P40202 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.13□□□□□ -1.11
CCS1P40202 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.13□□□□□ -1.11
CCS1P40202 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.13□□□□□ -1.11
CCS1P40202 SHY1YGR112W 1170 nt8.11□□□□□ -1.11
CCS1P40202 SAM1YLR180W 1149 nt8.11□□□□□ -1.11
CCS1P40202 HSL7YBR133C 2484 nt8.1□□□□□ -1.11
CCS1P40202 YBL086CYBL086C 1401 nt8.1□□□□□ -1.11
CCS1P40202 YJL067WYJL067W 351 nt8.09□□□□□ -1.11
CCS1P40202 SDH5YOL071W 489 nt8.09□□□□□ -1.11
CCS1P40202 ZTA1YBR046C 1005 nt8.09□□□□□ -1.11
CCS1P40202 SPT20YOL148C 1815 nt8.08□□□□□ -1.12
CCS1P40202 TSC10YBR265W 963 nt8.08□□□□□ -1.12
CCS1P40202 Q0182Q0182 405 nt8.07□□□□□ -1.12
CCS1P40202 TOA2YKL058W 369 nt8.07□□□□□ -1.12
CCS1P40202 RPC82YPR190C 1965 nt8.06□□□□□ -1.12
CCS1P40202 BRR1YPR057W 1026 nt8.05□□□□□ -1.12
CCS1P40202 LEU9YOR108W 1815 nt8.03□□□□□ -1.12
CCS1P40202 URA6YKL024C 615 nt8.03□□□□□ -1.12
CCS1P40202 YGR012WYGR012W 1182 nt8.01□□□□□ -1.13
CCS1P40202 YPL251WYPL251W 303 nt8.01□□□□□ -1.13
CCS1P40202 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.01□□□□□ -1.13
CCS1P40202 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.01□□□□□ -1.13
CCS1P40202 YLR279WYLR279W 390 nt8□□□□□ -1.13
CCS1P40202 GND2YGR256W 1479 nt8□□□□□ -1.13
CCS1P40202 MEP3YPR138C 1470 nt8□□□□□ -1.13
CCS1P40202 PET8YNL003C 855 nt7.99□□□□□ -1.13
CCS1P40202 CWC15YDR163W 528 nt7.98□□□□□ -1.13
CCS1P40202 SBA1YKL117W 651 nt7.98□□□□□ -1.13
CCS1P40202 YMR103CYMR103C 363 nt7.98□□□□□ -1.13
CCS1P40202 OYE3YPL171C 1203 nt7.98□□□□□ -1.13
CCS1P40202 UFO1YML088W 2007 nt7.98□□□□□ -1.13
CCS1P40202 SAM2YDR502C 1155 nt7.97□□□□□ -1.13
CCS1P40202 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.97□□□□□ -1.13
CCS1P40202 GLR1YPL091W 1452 nt7.97□□□□□ -1.13
CCS1P40202 YLR111WYLR111W 333 nt7.96□□□□□ -1.14
CCS1P40202 MSB4YOL112W 1479 nt7.95□□□□□ -1.14
CCS1P40202 HEL2YDR266C 1920 nt7.95□□□□□ -1.14
CCS1P40202 RAD23YEL037C 1197 nt7.94□□□□□ -1.14
CCS1P40202 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.94□□□□□ -1.14
CCS1P40202 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt7.92□□□□□ -1.14
CCS1P40202 UGA4YDL210W 1716 nt7.9□□□□□ -1.14
CCS1P40202 SEC61YLR378C 1443 nt7.89□□□□□ -1.15
CCS1P40202 APT2YDR441C 546 nt7.89□□□□□ -1.15
CCS1P40202 YNL024CYNL024C 741 nt7.89□□□□□ -1.15
CCS1P40202 ILV3YJR016C 1758 nt7.88□□□□□ -1.15
CCS1P40202 MUP1YGR055W 1725 nt7.88□□□□□ -1.15
CCS1P40202 SSN3YPL042C 1668 nt7.87□□□□□ -1.15
CCS1P40202 YMR226CYMR226C 804 nt7.87□□□□□ -1.15
CCS1P40202 SPP2YOR148C 558 nt7.87□□□□□ -1.15
CCS1P40202 FCY21YER060W 1587 nt7.87□□□□□ -1.15
CCS1P40202 YOR325WYOR325W 474 nt7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.4 ms