Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 UGA4YDL210W 1716 nt9.12□□□□□ -0.95
DDI1P40087 LSC2YGR244C 1284 nt9.11□□□□□ -0.95
DDI1P40087 MRPL8YJL063C 717 nt9.11□□□□□ -0.95
DDI1P40087 MUP1YGR055W 1725 nt9.11□□□□□ -0.95
DDI1P40087 GID7YCL039W 2238 nt9.09□□□□□ -0.95
DDI1P40087 ADO1YJR105W 1023 nt9.09□□□□□ -0.95
DDI1P40087 TIR3YIL011W 810 nt9.08□□□□□ -0.96
DDI1P40087 YJL067WYJL067W 351 nt9.05□□□□□ -0.96
DDI1P40087 YNL115CYNL115C 1935 nt9.03□□□□□ -0.96
DDI1P40087 PRO1YDR300C 1287 nt9.03□□□□□ -0.96
DDI1P40087 RTG1YOL067C 534 nt9.01□□□□□ -0.97
DDI1P40087 HXT1YHR094C 1713 nt9□□□□□ -0.97
DDI1P40087 ATG15YCR068W 1563 nt8.99□□□□□ -0.97
DDI1P40087 HOL1YNR055C 1761 nt8.99□□□□□ -0.97
DDI1P40087 URA8YJR103W 1737 nt8.99□□□□□ -0.97
DDI1P40087 YNL024CYNL024C 741 nt8.98□□□□□ -0.97
DDI1P40087 HUA1YGR268C 597 nt8.97□□□□□ -0.97
DDI1P40087 VPS75YNL246W 795 nt8.97□□□□□ -0.97
DDI1P40087 SSN3YPL042C 1668 nt8.97□□□□□ -0.97
DDI1P40087 POM34YLR018C 900 nt8.96□□□□□ -0.98
DDI1P40087 SHH4YLR164W 507 nt8.96□□□□□ -0.98
DDI1P40087 PEX25YPL112C 1185 nt8.95□□□□□ -0.98
DDI1P40087 DBP1YPL119C 1854 nt8.94□□□□□ -0.98
DDI1P40087 YML089CYML089C 369 nt8.94□□□□□ -0.98
DDI1P40087 ILV3YJR016C 1758 nt8.94□□□□□ -0.98
DDI1P40087 SHY1YGR112W 1170 nt8.92□□□□□ -0.98
DDI1P40087 DIF1YLR437C 402 nt8.92□□□□□ -0.98
DDI1P40087 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.91□□□□□ -0.98
DDI1P40087 PAU7YAR020C 168 nt8.91□□□□□ -0.98
DDI1P40087 HIS2YFR025C 1008 nt8.88□□□□□ -0.99
DDI1P40087 YOR325WYOR325W 474 nt8.88□□□□□ -0.99
DDI1P40087 CWC15YDR163W 528 nt8.87□□□□□ -0.99
DDI1P40087 YFL066CYFL066C 1179 nt8.85□□□□□ -0.99
DDI1P40087 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.85□□□□□ -0.99
DDI1P40087 LIP1YMR298W 453 nt8.85□□□□□ -0.99
DDI1P40087 TOM6YOR045W 186 nt8.84□□□□□ -0.99
DDI1P40087 YMR209CYMR209C 1374 nt8.84□□□□□ -0.99
DDI1P40087 YHL008CYHL008C 1884 nt8.83□□□□□ -1
DDI1P40087 MRP20YDR405W 792 nt8.83□□□□□ -1
DDI1P40087 PRE6YOL038W 765 nt8.83□□□□□ -1
DDI1P40087 RET2YFR051C 1641 nt8.83□□□□□ -1
DDI1P40087 COQ8YGL119W 1506 nt8.82□□□□□ -1
DDI1P40087 URA6YKL024C 615 nt8.81□□□□□ -1
DDI1P40087 YBL086CYBL086C 1401 nt8.8□□□□□ -1
DDI1P40087 GTB1YDR221W 2109 nt8.8□□□□□ -1
DDI1P40087 SED1YDR077W 1017 nt8.8□□□□□ -1
DDI1P40087 OPI10YOL032W 741 nt8.8□□□□□ -1
DDI1P40087 SFA1YDL168W 1161 nt8.79□□□□□ -1
DDI1P40087 CCT2YIL142W 1584 nt8.78□□□□□ -1
DDI1P40087 UBX6YJL048C 1191 nt8.78□□□□□ -1
DDI1P40087 SAM1YLR180W 1149 nt8.78□□□□□ -1
DDI1P40087 ARO8YGL202W 1503 nt8.77□□□□□ -1.01
DDI1P40087 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.77□□□□□ -1.01
DDI1P40087 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.77□□□□□ -1.01
DDI1P40087 YAR028WYAR028W 705 nt8.77□□□□□ -1.01
DDI1P40087 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.77□□□□□ -1.01
DDI1P40087 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.77□□□□□ -1.01
DDI1P40087 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.77□□□□□ -1.01
DDI1P40087 BET2YPR176C 978 nt8.76□□□□□ -1.01
DDI1P40087 YDR010CYDR010C 333 nt8.75□□□□□ -1.01
DDI1P40087 PEX2YJL210W 816 nt8.75□□□□□ -1.01
DDI1P40087 SHB17YKR043C 816 nt8.75□□□□□ -1.01
DDI1P40087 TIF6YPR016C 738 nt8.75□□□□□ -1.01
DDI1P40087 THI72YOR192C 1800 nt8.75□□□□□ -1.01
DDI1P40087 ESBP6YNL125C 2022 nt8.75□□□□□ -1.01
DDI1P40087 UGP1YKL035W 1500 nt8.75□□□□□ -1.01
DDI1P40087 TOA2YKL058W 369 nt8.74□□□□□ -1.01
DDI1P40087 PET8YNL003C 855 nt8.74□□□□□ -1.01
DDI1P40087 KES1YPL145C 1305 nt8.74□□□□□ -1.01
DDI1P40087 ILV2YMR108W 2064 nt8.73□□□□□ -1.01
DDI1P40087 FRE6YLL051C 2139 nt8.73□□□□□ -1.01
DDI1P40087 OYE3YPL171C 1203 nt8.72□□□□□ -1.01
DDI1P40087 UFO1YML088W 2007 nt8.71□□□□□ -1.02
DDI1P40087 LEU9YOR108W 1815 nt8.7□□□□□ -1.02
DDI1P40087 HXK1YFR053C 1458 nt8.7□□□□□ -1.02
DDI1P40087 SGA1YIL099W 1650 nt8.7□□□□□ -1.02
DDI1P40087 YDR094WYDR094W 336 nt8.7□□□□□ -1.02
DDI1P40087 BRR1YPR057W 1026 nt8.7□□□□□ -1.02
DDI1P40087 HIP1YGR191W 1812 nt8.69□□□□□ -1.02
DDI1P40087 MET28YIR017C 564 nt8.69□□□□□ -1.02
DDI1P40087 CYT1YOR065W 930 nt8.69□□□□□ -1.02
DDI1P40087 MTG2YHR168W 1557 nt8.68□□□□□ -1.02
DDI1P40087 PHO89YBR296C 1725 nt8.68□□□□□ -1.02
DDI1P40087 YFR018CYFR018C 1092 nt8.67□□□□□ -1.02
DDI1P40087 PSD1YNL169C 1503 nt8.67□□□□□ -1.02
DDI1P40087 ALD5YER073W 1563 nt8.66□□□□□ -1.02
DDI1P40087 GND2YGR256W 1479 nt8.66□□□□□ -1.02
DDI1P40087 AKR2YOR034C 2250 nt8.65□□□□□ -1.02
DDI1P40087 VPS62YGR141W 1404 nt8.65□□□□□ -1.02
DDI1P40087 SPP2YOR148C 558 nt8.65□□□□□ -1.02
DDI1P40087 SAM2YDR502C 1155 nt8.64□□□□□ -1.03
DDI1P40087 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.64□□□□□ -1.03
DDI1P40087 LSB6YJL100W 1824 nt8.64□□□□□ -1.03
DDI1P40087 ALP1YNL270C 1722 nt8.63□□□□□ -1.03
DDI1P40087 QDR2YIL121W 1629 nt8.62□□□□□ -1.03
DDI1P40087 YPL251WYPL251W 303 nt8.62□□□□□ -1.03
DDI1P40087 GAL2YLR081W 1725 nt8.62□□□□□ -1.03
DDI1P40087 NRT1YOR071C 1797 nt8.61□□□□□ -1.03
DDI1P40087 YDL086WYDL086W 822 nt8.61□□□□□ -1.03
DDI1P40087 DMA2YNL116W 1569 nt8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.6 ms