Protein–RNA interactions for Protein: P13712

MSI1, Chromatin assembly factor 1 subunit p50, yeastyeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSI1P13712 YCR087WYCR087W 516 nt8.58□□□□□ -1.04
MSI1P13712 SNF1YDR477W 1902 nt8.57□□□□□ -1.04
MSI1P13712 IRC24YIR036C 792 nt8.57□□□□□ -1.04
MSI1P13712 POM34YLR018C 900 nt8.57□□□□□ -1.04
MSI1P13712 BIO5YNR056C 1686 nt8.56□□□□□ -1.04
MSI1P13712 PLB1YMR008C 1995 nt8.56□□□□□ -1.04
MSI1P13712 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.56□□□□□ -1.04
MSI1P13712 XYL2YLR070C 1071 nt8.56□□□□□ -1.04
MSI1P13712 GLR1YPL091W 1452 nt8.56□□□□□ -1.04
MSI1P13712 PRO1YDR300C 1287 nt8.54□□□□□ -1.04
MSI1P13712 YMR244WYMR244W 1068 nt8.53□□□□□ -1.04
MSI1P13712 COQ2YNR041C 1119 nt8.53□□□□□ -1.04
MSI1P13712 YML089CYML089C 369 nt8.52□□□□□ -1.05
MSI1P13712 TOM6YOR045W 186 nt8.51□□□□□ -1.05
MSI1P13712 PBP1YGR178C 2169 nt8.51□□□□□ -1.05
MSI1P13712 NDI1YML120C 1542 nt8.5□□□□□ -1.05
MSI1P13712 GAP1YKR039W 1809 nt8.5□□□□□ -1.05
MSI1P13712 MRP20YDR405W 792 nt8.5□□□□□ -1.05
MSI1P13712 CYT2YKL087C 675 nt8.49□□□□□ -1.05
MSI1P13712 AIM45YPR004C 1035 nt8.49□□□□□ -1.05
MSI1P13712 RBG1YAL036C 1110 nt8.47□□□□□ -1.05
MSI1P13712 ATG15YCR068W 1563 nt8.46□□□□□ -1.06
MSI1P13712 HIP1YGR191W 1812 nt8.45□□□□□ -1.06
MSI1P13712 UTR1YJR049C 1593 nt8.44□□□□□ -1.06
MSI1P13712 PEX2YJL210W 816 nt8.43□□□□□ -1.06
MSI1P13712 TIF6YPR016C 738 nt8.43□□□□□ -1.06
MSI1P13712 RPL4BYDR012W 1089 nt8.42□□□□□ -1.06
MSI1P13712 RPL4AYBR031W 1089 nt8.42□□□□□ -1.06
MSI1P13712 RBG2YGR173W 1107 nt8.41□□□□□ -1.06
MSI1P13712 YMR226CYMR226C 804 nt8.41□□□□□ -1.06
MSI1P13712 CLB6YGR109C 1143 nt8.4□□□□□ -1.06
MSI1P13712 PRM5YIL117C 957 nt8.38□□□□□ -1.07
MSI1P13712 MET28YIR017C 564 nt8.38□□□□□ -1.07
MSI1P13712 RPS14BYJL191W 417 nt8.38□□□□□ -1.07
MSI1P13712 UTH1YKR042W 1098 nt8.38□□□□□ -1.07
MSI1P13712 DIF1YLR437C 402 nt8.37□□□□□ -1.07
MSI1P13712 NRT1YOR071C 1797 nt8.36□□□□□ -1.07
MSI1P13712 ALD4YOR374W 1560 nt8.33□□□□□ -1.08
MSI1P13712 SAM35YHR083W 990 nt8.32□□□□□ -1.08
MSI1P13712 HIF1YLL022C 1158 nt8.31□□□□□ -1.08
MSI1P13712 YLR111WYLR111W 333 nt8.29□□□□□ -1.08
MSI1P13712 YAR028WYAR028W 705 nt8.29□□□□□ -1.08
MSI1P13712 FIT3YOR383C 615 nt8.29□□□□□ -1.08
MSI1P13712 CMP2YML057W 1815 nt8.29□□□□□ -1.08
MSI1P13712 MTG2YHR168W 1557 nt8.27□□□□□ -1.09
MSI1P13712 TSC10YBR265W 963 nt8.27□□□□□ -1.09
MSI1P13712 DBP1YPL119C 1854 nt8.26□□□□□ -1.09
MSI1P13712 ALP1YNL270C 1722 nt8.24□□□□□ -1.09
MSI1P13712 SDH5YOL071W 489 nt8.24□□□□□ -1.09
MSI1P13712 RAD23YEL037C 1197 nt8.23□□□□□ -1.09
MSI1P13712 YAT1YAR035W 2064 nt8.23□□□□□ -1.09
MSI1P13712 YLR279WYLR279W 390 nt8.22□□□□□ -1.09
MSI1P13712 YGR012WYGR012W 1182 nt8.21□□□□□ -1.1
MSI1P13712 ZTA1YBR046C 1005 nt8.21□□□□□ -1.1
MSI1P13712 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.2□□□□□ -1.1
MSI1P13712 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.2□□□□□ -1.1
MSI1P13712 SAM1YLR180W 1149 nt8.2□□□□□ -1.1
MSI1P13712 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.2□□□□□ -1.1
MSI1P13712 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.2□□□□□ -1.1
MSI1P13712 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.2□□□□□ -1.1
MSI1P13712 SED1YDR077W 1017 nt8.19□□□□□ -1.1
MSI1P13712 AKR2YOR034C 2250 nt8.18□□□□□ -1.1
MSI1P13712 HXT1YHR094C 1713 nt8.18□□□□□ -1.1
MSI1P13712 LIP1YMR298W 453 nt8.17□□□□□ -1.1
MSI1P13712 MSB4YOL112W 1479 nt8.16□□□□□ -1.1
MSI1P13712 ZRT3YKL175W 1512 nt8.14□□□□□ -1.11
MSI1P13712 YBL086CYBL086C 1401 nt8.14□□□□□ -1.11
MSI1P13712 CAB5YDR196C 726 nt8.13□□□□□ -1.11
MSI1P13712 RIB3YDR487C 627 nt8.13□□□□□ -1.11
MSI1P13712 SPT20YOL148C 1815 nt8.13□□□□□ -1.11
MSI1P13712 LEU9YOR108W 1815 nt8.13□□□□□ -1.11
MSI1P13712 SHY1YGR112W 1170 nt8.12□□□□□ -1.11
MSI1P13712 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.12□□□□□ -1.11
MSI1P13712 FRE6YLL051C 2139 nt8.11□□□□□ -1.11
MSI1P13712 INA1YLR413W 2028 nt8.11□□□□□ -1.11
MSI1P13712 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.1□□□□□ -1.11
MSI1P13712 HSL7YBR133C 2484 nt8.09□□□□□ -1.11
MSI1P13712 YPL251WYPL251W 303 nt8.09□□□□□ -1.11
MSI1P13712 HEL2YDR266C 1920 nt8.07□□□□□ -1.12
MSI1P13712 FCY21YER060W 1587 nt8.07□□□□□ -1.12
MSI1P13712 BRR1YPR057W 1026 nt8.07□□□□□ -1.12
MSI1P13712 RPC82YPR190C 1965 nt8.06□□□□□ -1.12
MSI1P13712 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.06□□□□□ -1.12
MSI1P13712 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.06□□□□□ -1.12
MSI1P13712 UFO1YML088W 2007 nt8.05□□□□□ -1.12
MSI1P13712 APT2YDR441C 546 nt8.05□□□□□ -1.12
MSI1P13712 URA6YKL024C 615 nt8.04□□□□□ -1.12
MSI1P13712 TOA2YKL058W 369 nt8.04□□□□□ -1.12
MSI1P13712 UGA4YDL210W 1716 nt8.03□□□□□ -1.12
MSI1P13712 YJL067WYJL067W 351 nt8.03□□□□□ -1.12
MSI1P13712 YMR103CYMR103C 363 nt8.02□□□□□ -1.13
MSI1P13712 GND1YHR183W 1470 nt8.01□□□□□ -1.13
MSI1P13712 MEP3YPR138C 1470 nt8□□□□□ -1.13
MSI1P13712 TRT2tT(CGU)K 72 nt8□□□□□ -1.13
MSI1P13712 SMM1YNR015W 1155 nt7.99□□□□□ -1.13
MSI1P13712 GND2YGR256W 1479 nt7.99□□□□□ -1.13
MSI1P13712 YPI1YFR003C 468 nt7.98□□□□□ -1.13
MSI1P13712 LOT5YKL183W 921 nt7.97□□□□□ -1.13
MSI1P13712 OYE3YPL171C 1203 nt7.97□□□□□ -1.13
MSI1P13712 MET2YNL277W 1461 nt7.96□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.1 ms