Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
DmdP11531 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
DmdP11531 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
DmdP11531 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
DmdP11531 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
DmdP11531 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,87■■□□□ 1,73
DmdP11531 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
DmdP11531 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
DmdP11531 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
DmdP11531 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
DmdP11531 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
DmdP11531 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
DmdP11531 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
DmdP11531 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,75■■□□□ 1,71
DmdP11531 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,75■■□□□ 1,71
DmdP11531 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
DmdP11531 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
DmdP11531 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
DmdP11531 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
DmdP11531 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25,7■■□□□ 1,7
DmdP11531 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
DmdP11531 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
DmdP11531 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
DmdP11531 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
DmdP11531 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,66■■□□□ 1,7
DmdP11531 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
DmdP11531 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25,66■■□□□ 1,7
DmdP11531 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
DmdP11531 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
DmdP11531 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
DmdP11531 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
DmdP11531 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,62■■□□□ 1,69
DmdP11531 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
DmdP11531 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
DmdP11531 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,6■■□□□ 1,69
DmdP11531 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
DmdP11531 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
DmdP11531 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
DmdP11531 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
DmdP11531 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
DmdP11531 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
DmdP11531 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
DmdP11531 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
DmdP11531 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
DmdP11531 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
DmdP11531 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,54■■□□□ 1,68
DmdP11531 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,53■■□□□ 1,68
DmdP11531 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
DmdP11531 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25,51■■□□□ 1,67
DmdP11531 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
DmdP11531 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
DmdP11531 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
DmdP11531 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
DmdP11531 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25,49■■□□□ 1,67
DmdP11531 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
DmdP11531 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
DmdP11531 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,48■■□□□ 1,67
DmdP11531 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
DmdP11531 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
DmdP11531 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
DmdP11531 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
DmdP11531 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
DmdP11531 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
DmdP11531 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
DmdP11531 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
DmdP11531 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
DmdP11531 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,43■■□□□ 1,66
DmdP11531 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
DmdP11531 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
DmdP11531 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
DmdP11531 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
DmdP11531 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
DmdP11531 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
DmdP11531 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
DmdP11531 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
DmdP11531 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
DmdP11531 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
DmdP11531 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
DmdP11531 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
DmdP11531 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
DmdP11531 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
DmdP11531 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
DmdP11531 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,31■■□□□ 1,64
DmdP11531 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
DmdP11531 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
DmdP11531 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
DmdP11531 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,3■■□□□ 1,64
DmdP11531 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
DmdP11531 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
DmdP11531 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,27■■□□□ 1,64
DmdP11531 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
DmdP11531 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
DmdP11531 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
DmdP11531 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
DmdP11531 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
DmdP11531 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,25■■□□□ 1,63
DmdP11531 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
DmdP11531 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,25■■□□□ 1,63
DmdP11531 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
DmdP11531 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms