Protein–RNA interactions for Protein: P0CX48

RPS11B, 40S ribosomal protein S11-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS11BP0CX48 POM34YLR018C 900 nt7.44□□□□□ -1.22
RPS11BP0CX48 SNF1YDR477W 1902 nt7.43□□□□□ -1.22
RPS11BP0CX48 PRO1YDR300C 1287 nt7.43□□□□□ -1.22
RPS11BP0CX48 SHH4YLR164W 507 nt7.43□□□□□ -1.22
RPS11BP0CX48 GAP1YKR039W 1809 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS11BP0CX48 ATG15YCR068W 1563 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS11BP0CX48 MCH5YOR306C 1566 nt7.42□□□□□ -1.22
RPS11BP0CX48 XYL2YLR070C 1071 nt7.41□□□□□ -1.22
RPS11BP0CX48 COQ2YNR041C 1119 nt7.4□□□□□ -1.22
RPS11BP0CX48 AIM45YPR004C 1035 nt7.4□□□□□ -1.22
RPS11BP0CX48 CLB6YGR109C 1143 nt7.39□□□□□ -1.23
RPS11BP0CX48 SAM35YHR083W 990 nt7.39□□□□□ -1.23
RPS11BP0CX48 TOM6YOR045W 186 nt7.39□□□□□ -1.23
RPS11BP0CX48 BIO5YNR056C 1686 nt7.38□□□□□ -1.23
RPS11BP0CX48 RPL4BYDR012W 1089 nt7.36□□□□□ -1.23
RPS11BP0CX48 RPL4AYBR031W 1089 nt7.36□□□□□ -1.23
RPS11BP0CX48 UTH1YKR042W 1098 nt7.35□□□□□ -1.23
RPS11BP0CX48 UTR1YJR049C 1593 nt7.34□□□□□ -1.23
RPS11BP0CX48 PEX2YJL210W 816 nt7.34□□□□□ -1.23
RPS11BP0CX48 HIP1YGR191W 1812 nt7.34□□□□□ -1.24
RPS11BP0CX48 MET28YIR017C 564 nt7.33□□□□□ -1.24
RPS11BP0CX48 RBG1YAL036C 1110 nt7.33□□□□□ -1.24
RPS11BP0CX48 TIF6YPR016C 738 nt7.33□□□□□ -1.24
RPS11BP0CX48 PRM5YIL117C 957 nt7.32□□□□□ -1.24
RPS11BP0CX48 ALD4YOR374W 1560 nt7.31□□□□□ -1.24
RPS11BP0CX48 NDI1YML120C 1542 nt7.31□□□□□ -1.24
RPS11BP0CX48 NRT1YOR071C 1797 nt7.31□□□□□ -1.24
RPS11BP0CX48 PBP1YGR178C 2169 nt7.3□□□□□ -1.24
RPS11BP0CX48 DIF1YLR437C 402 nt7.3□□□□□ -1.24
RPS11BP0CX48 NAR1YNL240C 1476 nt7.29□□□□□ -1.24
RPS11BP0CX48 RPS14BYJL191W 417 nt7.28□□□□□ -1.24
RPS11BP0CX48 FIT3YOR383C 615 nt7.28□□□□□ -1.24
RPS11BP0CX48 CYT2YKL087C 675 nt7.27□□□□□ -1.25
RPS11BP0CX48 YAR028WYAR028W 705 nt7.27□□□□□ -1.25
RPS11BP0CX48 HIF1YLL022C 1158 nt7.26□□□□□ -1.25
RPS11BP0CX48 TSC10YBR265W 963 nt7.23□□□□□ -1.25
RPS11BP0CX48 SDH5YOL071W 489 nt7.22□□□□□ -1.25
RPS11BP0CX48 GLR1YPL091W 1452 nt7.22□□□□□ -1.25
RPS11BP0CX48 SED1YDR077W 1017 nt7.2□□□□□ -1.26
RPS11BP0CX48 ALP1YNL270C 1722 nt7.2□□□□□ -1.26
RPS11BP0CX48 HXT1YHR094C 1713 nt7.18□□□□□ -1.26
RPS11BP0CX48 AKR2YOR034C 2250 nt7.18□□□□□ -1.26
RPS11BP0CX48 MTG2YHR168W 1557 nt7.17□□□□□ -1.26
RPS11BP0CX48 SBA1YKL117W 651 nt7.17□□□□□ -1.26
RPS11BP0CX48 LIP1YMR298W 453 nt7.17□□□□□ -1.26
RPS11BP0CX48 ZRT3YKL175W 1512 nt7.17□□□□□ -1.26
RPS11BP0CX48 DBP1YPL119C 1854 nt7.16□□□□□ -1.26
RPS11BP0CX48 YLR111WYLR111W 333 nt7.16□□□□□ -1.26
RPS11BP0CX48 RAD23YEL037C 1197 nt7.15□□□□□ -1.26
RPS11BP0CX48 YGR012WYGR012W 1182 nt7.14□□□□□ -1.27
RPS11BP0CX48 YMR226CYMR226C 804 nt7.14□□□□□ -1.27
RPS11BP0CX48 YLR279WYLR279W 390 nt7.13□□□□□ -1.27
RPS11BP0CX48 YMR244WYMR244W 1068 nt7.12□□□□□ -1.27
RPS11BP0CX48 ZTA1YBR046C 1005 nt7.12□□□□□ -1.27
RPS11BP0CX48 SAM1YLR180W 1149 nt7.11□□□□□ -1.27
RPS11BP0CX48 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.1□□□□□ -1.27
RPS11BP0CX48 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.1□□□□□ -1.27
RPS11BP0CX48 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.1□□□□□ -1.27
RPS11BP0CX48 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.1□□□□□ -1.27
RPS11BP0CX48 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.1□□□□□ -1.27
RPS11BP0CX48 YBL086CYBL086C 1401 nt7.1□□□□□ -1.27
RPS11BP0CX48 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.08□□□□□ -1.28
RPS11BP0CX48 SHY1YGR112W 1170 nt7.07□□□□□ -1.28
RPS11BP0CX48 LEU9YOR108W 1815 nt7.06□□□□□ -1.28
RPS11BP0CX48 MSB4YOL112W 1479 nt7.06□□□□□ -1.28
RPS11BP0CX48 APT2YDR441C 546 nt7.05□□□□□ -1.28
RPS11BP0CX48 RIB3YDR487C 627 nt7.05□□□□□ -1.28
RPS11BP0CX48 TOA2YKL058W 369 nt7.05□□□□□ -1.28
RPS11BP0CX48 BRR1YPR057W 1026 nt7.05□□□□□ -1.28
RPS11BP0CX48 INA1YLR413W 2028 nt7.05□□□□□ -1.28
RPS11BP0CX48 YAT1YAR035W 2064 nt7.04□□□□□ -1.28
RPS11BP0CX48 URA6YKL024C 615 nt7.04□□□□□ -1.28
RPS11BP0CX48 YPL251WYPL251W 303 nt7.04□□□□□ -1.28
RPS11BP0CX48 RBG2YGR173W 1107 nt7.03□□□□□ -1.28
RPS11BP0CX48 MEP3YPR138C 1470 nt7.01□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 YJL067WYJL067W 351 nt7.01□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 GND1YHR183W 1470 nt7□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 TRT2tT(CGU)K 72 nt7□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 FCY21YER060W 1587 nt6.99□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 PET8YNL003C 855 nt6.99□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 UFO1YML088W 2007 nt6.99□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 RDN25-1RDN25-1 3396 nt6.98□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 RDN25-2RDN25-2 3396 nt6.98□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 SAM2YDR502C 1155 nt6.98□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt6.98□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 YMR103CYMR103C 363 nt6.98□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 OYE3YPL171C 1203 nt6.98□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 CMP2YML057W 1815 nt6.98□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 GND2YGR256W 1479 nt6.98□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 UGA4YDL210W 1716 nt6.96□□□□□ -1.29
RPS11BP0CX48 RPC82YPR190C 1965 nt6.95□□□□□ -1.3
RPS11BP0CX48 SPT20YOL148C 1815 nt6.95□□□□□ -1.3
RPS11BP0CX48 SEC61YLR378C 1443 nt6.94□□□□□ -1.3
RPS11BP0CX48 CWC15YDR163W 528 nt6.94□□□□□ -1.3
RPS11BP0CX48 LOT5YKL183W 921 nt6.94□□□□□ -1.3
RPS11BP0CX48 OXA1YER154W 1209 nt6.93□□□□□ -1.3
RPS11BP0CX48 CAB5YDR196C 726 nt6.92□□□□□ -1.3
RPS11BP0CX48 PRY1YJL079C 900 nt6.92□□□□□ -1.3
RPS11BP0CX48 SMM1YNR015W 1155 nt6.92□□□□□ -1.3
RPS11BP0CX48 SSN3YPL042C 1668 nt6.91□□□□□ -1.3
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