Protein–RNA interactions for Protein: P04435

TCRB, T-cell receptor beta chain V region CTL-L17, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBP04435 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBP04435 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBP04435 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBP04435 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBP04435 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBP04435 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCRBP04435 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCRBP04435 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCRBP04435 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCRBP04435 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBP04435 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBP04435 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TCRBP04435 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCRBP04435 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBP04435 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBP04435 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBP04435 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBP04435 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCRBP04435 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCRBP04435 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCRBP04435 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCRBP04435 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCRBP04435 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBP04435 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBP04435 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBP04435 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBP04435 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBP04435 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCRBP04435 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCRBP04435 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCRBP04435 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCRBP04435 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCRBP04435 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCRBP04435 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCRBP04435 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCRBP04435 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCRBP04435 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCRBP04435 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCRBP04435 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCRBP04435 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCRBP04435 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCRBP04435 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBP04435 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBP04435 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCRBP04435 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCRBP04435 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCRBP04435 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBP04435 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBP04435 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCRBP04435 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCRBP04435 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCRBP04435 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCRBP04435 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCRBP04435 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCRBP04435 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TCRBP04435 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCRBP04435 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TCRBP04435 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCRBP04435 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCRBP04435 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCRBP04435 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCRBP04435 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCRBP04435 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCRBP04435 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCRBP04435 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCRBP04435 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCRBP04435 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCRBP04435 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCRBP04435 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCRBP04435 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCRBP04435 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCRBP04435 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCRBP04435 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCRBP04435 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCRBP04435 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCRBP04435 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBP04435 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBP04435 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBP04435 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBP04435 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBP04435 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBP04435 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBP04435 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBP04435 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBP04435 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBP04435 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBP04435 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBP04435 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBP04435 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBP04435 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBP04435 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBP04435 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBP04435 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBP04435 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBP04435 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBP04435 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBP04435 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBP04435 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBP04435 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBP04435 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms