Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYF2O95926 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYF2O95926 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYF2O95926 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYF2O95926 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYF2O95926 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYF2O95926 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYF2O95926 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYF2O95926 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYF2O95926 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYF2O95926 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYF2O95926 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYF2O95926 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYF2O95926 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYF2O95926 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYF2O95926 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYF2O95926 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYF2O95926 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYF2O95926 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYF2O95926 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYF2O95926 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYF2O95926 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYF2O95926 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYF2O95926 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYF2O95926 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYF2O95926 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYF2O95926 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYF2O95926 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYF2O95926 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYF2O95926 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYF2O95926 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYF2O95926 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYF2O95926 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYF2O95926 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYF2O95926 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYF2O95926 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYF2O95926 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYF2O95926 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYF2O95926 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYF2O95926 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYF2O95926 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYF2O95926 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYF2O95926 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYF2O95926 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYF2O95926 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYF2O95926 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYF2O95926 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYF2O95926 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYF2O95926 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYF2O95926 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYF2O95926 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYF2O95926 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYF2O95926 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYF2O95926 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYF2O95926 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYF2O95926 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYF2O95926 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYF2O95926 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYF2O95926 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYF2O95926 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYF2O95926 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYF2O95926 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYF2O95926 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYF2O95926 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYF2O95926 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SYF2O95926 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYF2O95926 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYF2O95926 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYF2O95926 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYF2O95926 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYF2O95926 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYF2O95926 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYF2O95926 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYF2O95926 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYF2O95926 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYF2O95926 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYF2O95926 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYF2O95926 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYF2O95926 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYF2O95926 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYF2O95926 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYF2O95926 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYF2O95926 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYF2O95926 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYF2O95926 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYF2O95926 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYF2O95926 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYF2O95926 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYF2O95926 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYF2O95926 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYF2O95926 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYF2O95926 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SYF2O95926 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYF2O95926 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYF2O95926 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYF2O95926 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYF2O95926 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYF2O95926 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYF2O95926 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYF2O95926 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms