Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QR89 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QR89 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QR89 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QR89 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QR89 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QR89 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QR89 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
J3QR89 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
J3QR89 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QR89 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
J3QR89 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3QR89 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3QR89 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3QR89 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3QR89 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3QR89 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3QR89 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3QR89 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3QR89 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3QR89 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3QR89 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3QR89 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3QR89 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3QR89 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3QR89 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3QR89 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3QR89 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QR89 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3QR89 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QR89 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
J3QR89 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QR89 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
J3QR89 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QR89 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QR89 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
J3QR89 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QR89 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QR89 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QR89 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
J3QR89 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QR89 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QR89 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QR89 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
J3QR89 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
J3QR89 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QR89 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QR89 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QR89 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
J3QR89 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QR89 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QR89 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QR89 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QR89 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QR89 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QR89 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QR89 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QR89 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QR89 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QR89 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QR89 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QR89 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QR89 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
J3QR89 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QR89 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QR89 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QR89 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QR89 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QR89 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QR89 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QR89 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QR89 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QR89 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QR89 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QR89 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QR89 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QR89 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QR89 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QR89 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QR89 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QR89 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QR89 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3QR89 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QR89 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QR89 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3QR89 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3QR89 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QR89 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3QR89 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QR89 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QR89 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QR89 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3QR89 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3QR89 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QR89 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
J3QR89 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QR89 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QR89 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QR89 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
J3QR89 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms