Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc179J3QM76 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc179J3QM76 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc179J3QM76 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc179J3QM76 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc179J3QM76 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc179J3QM76 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc179J3QM76 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc179J3QM76 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc179J3QM76 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc179J3QM76 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc179J3QM76 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc179J3QM76 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc179J3QM76 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc179J3QM76 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc179J3QM76 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc179J3QM76 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc179J3QM76 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc179J3QM76 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc179J3QM76 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc179J3QM76 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc179J3QM76 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc179J3QM76 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc179J3QM76 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms