Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r40F6W043 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r40F6W043 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn2r40F6W043 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn2r40F6W043 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r40F6W043 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r40F6W043 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r40F6W043 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r40F6W043 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r40F6W043 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r40F6W043 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r40F6W043 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r40F6W043 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r40F6W043 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r40F6W043 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r40F6W043 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r40F6W043 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r40F6W043 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r40F6W043 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r40F6W043 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r40F6W043 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r40F6W043 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r40F6W043 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r40F6W043 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r40F6W043 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r40F6W043 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r40F6W043 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r40F6W043 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r40F6W043 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r40F6W043 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r40F6W043 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r40F6W043 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r40F6W043 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r40F6W043 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r40F6W043 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r40F6W043 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r40F6W043 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r40F6W043 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r40F6W043 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r40F6W043 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r40F6W043 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r40F6W043 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r40F6W043 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r40F6W043 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r40F6W043 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r40F6W043 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r40F6W043 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r40F6W043 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r40F6W043 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r40F6W043 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r40F6W043 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r40F6W043 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r40F6W043 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r40F6W043 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn2r40F6W043 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r40F6W043 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r40F6W043 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r40F6W043 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r40F6W043 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r40F6W043 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r40F6W043 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r40F6W043 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r40F6W043 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r40F6W043 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r40F6W043 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r40F6W043 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r40F6W043 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r40F6W043 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r40F6W043 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r40F6W043 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r40F6W043 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r40F6W043 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r40F6W043 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r40F6W043 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r40F6W043 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r40F6W043 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r40F6W043 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r40F6W043 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vmn2r40F6W043 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r40F6W043 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r40F6W043 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r40F6W043 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r40F6W043 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r40F6W043 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r40F6W043 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms