Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF222A6NCQ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF222A6NCQ9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF222A6NCQ9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF222A6NCQ9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF222A6NCQ9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF222A6NCQ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF222A6NCQ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF222A6NCQ9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF222A6NCQ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF222A6NCQ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF222A6NCQ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF222A6NCQ9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF222A6NCQ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF222A6NCQ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF222A6NCQ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF222A6NCQ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF222A6NCQ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF222A6NCQ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF222A6NCQ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF222A6NCQ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF222A6NCQ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF222A6NCQ9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF222A6NCQ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF222A6NCQ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF222A6NCQ9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF222A6NCQ9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF222A6NCQ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF222A6NCQ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF222A6NCQ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF222A6NCQ9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF222A6NCQ9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF222A6NCQ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF222A6NCQ9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF222A6NCQ9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF222A6NCQ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF222A6NCQ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF222A6NCQ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF222A6NCQ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF222A6NCQ9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF222A6NCQ9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF222A6NCQ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF222A6NCQ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF222A6NCQ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF222A6NCQ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF222A6NCQ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF222A6NCQ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF222A6NCQ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF222A6NCQ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF222A6NCQ9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF222A6NCQ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF222A6NCQ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF222A6NCQ9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF222A6NCQ9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF222A6NCQ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF222A6NCQ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF222A6NCQ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF222A6NCQ9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF222A6NCQ9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF222A6NCQ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF222A6NCQ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF222A6NCQ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF222A6NCQ9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms