Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms