Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPJ1

1700017N19Rik, RIKEN cDNA 1700017N19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700017N19RikA0A087WPJ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
1700017N19RikA0A087WPJ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
1700017N19RikA0A087WPJ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700017N19RikA0A087WPJ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700017N19RikA0A087WPJ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700017N19RikA0A087WPJ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700017N19RikA0A087WPJ1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700017N19RikA0A087WPJ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700017N19RikA0A087WPJ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
1700017N19RikA0A087WPJ1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
1700017N19RikA0A087WPJ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700017N19RikA0A087WPJ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700017N19RikA0A087WPJ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700017N19RikA0A087WPJ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
1700017N19RikA0A087WPJ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
1700017N19RikA0A087WPJ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
1700017N19RikA0A087WPJ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms