Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 PMEL-218ENST00000552882 2516 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 CDC20B-201ENST00000296733 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 RHBDL3-203ENST00000536287 4470 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TRAF6Q9Y4K3 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 ITGB1-202ENST00000396033 3784 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 AGK-201ENST00000355413 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TRAF6Q9Y4K3 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TRAF6Q9Y4K3 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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TRAF6Q9Y4K3 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 LINC02105-202ENST00000511953 870 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 LMO3-228ENST00000541846 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TRAF6Q9Y4K3 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TRAF6Q9Y4K3 ENPP5-201ENST00000230565 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TRAF6Q9Y4K3 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 ZNF670-201ENST00000366503 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TRAF6Q9Y4K3 USP5-202ENST00000389231 3083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TRAF6Q9Y4K3 AC093525.7-201ENST00000569852 3626 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 AKAP10-201ENST00000225737 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA8Q-201ENST00000562783 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC073263.2-201ENST00000624835 1863 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 TP53-208ENST00000504290 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 TAF1C-218ENST00000567759 3879 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 TP53-220ENST00000610623 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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TRAF6Q9Y4K3 PCYT1B-202ENST00000379144 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 ZNF169-204ENST00000481550 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 STAT2-201ENST00000314128 3259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 ZNF572-201ENST00000319286 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 ZNF730-202ENST00000597761 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC130456.2-201ENST00000563613 1937 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 UCP3-201ENST00000314032 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 USHBP1-201ENST00000252597 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 CETN3-201ENST00000283122 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 DESI1-201ENST00000263256 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRAF6Q9Y4K3 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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