Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAD1L1Q9Y6D9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAD1L1Q9Y6D9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms