Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX9Q9Y5X1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms