Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL4A3BPQ9Y5P4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A3BPQ9Y5P4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms