Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB4Q9Y5E5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms