Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIF3AQ9Y496 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3AQ9Y496 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3AQ9Y496 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms