Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
THRAP3Q9Y2W1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms