Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG6Q9Y2V7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.57■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.57■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.54■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.54■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms