Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIK3Q9Y2K2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK3Q9Y2K2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms