Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC5Q9UQL6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HDAC5Q9UQL6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms