Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHF24Q9UPV7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF24Q9UPV7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF24Q9UPV7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms