Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDZRN3Q9UPQ7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDZRN3Q9UPQ7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZRN3Q9UPQ7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms