Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA4Q9UN74 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA4Q9UN74 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms