Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN11Q9UMQ6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN11Q9UMQ6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN11Q9UMQ6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN11Q9UMQ6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN11Q9UMQ6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN11Q9UMQ6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN11Q9UMQ6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN11Q9UMQ6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN11Q9UMQ6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN11Q9UMQ6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN11Q9UMQ6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN11Q9UMQ6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN11Q9UMQ6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN11Q9UMQ6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN11Q9UMQ6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN11Q9UMQ6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms