Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALD1Q9ULE6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms