Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms