Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN16Q9UKR8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms