Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CHIC2Q9UKJ5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CHIC2Q9UKJ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHIC2Q9UKJ5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHIC2Q9UKJ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms