Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3LQ9UJW3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNMT3LQ9UJW3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms