Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIQ6

LNPEP, Leucyl-cystinyl aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPEPQ9UIQ6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LNPEPQ9UIQ6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPEPQ9UIQ6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms