Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLCO3A1Q9UIG8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLCO3A1Q9UIG8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms