Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN4Q9UHM6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OPN4Q9UHM6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 305.2 ms