Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms