Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFMBT1Q9UHJ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT1Q9UHJ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT1Q9UHJ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms