Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHORDC1Q9UHD1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHORDC1Q9UHD1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHORDC1Q9UHD1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms