Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3BQ9UH17 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3BQ9UH17 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3BQ9UH17 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms